Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms