Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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USP17L12C9JPN9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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USP17L12C9JPN9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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USP17L12C9JPN9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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USP17L12C9JPN9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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USP17L12C9JPN9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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