Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUCLA2Q9P2R7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLA2Q9P2R7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms