Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA13Q9P0J0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms