Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD3Q9NYI0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms