Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms