Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBN4Q9H254 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN4Q9H254 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms