Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR88Q9GZN0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR88Q9GZN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR88Q9GZN0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR88Q9GZN0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR88Q9GZN0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPR88Q9GZN0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPR88Q9GZN0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPR88Q9GZN0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR88Q9GZN0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms