Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms