Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAQ8NFP9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBEAQ8NFP9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBEAQ8NFP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBEAQ8NFP9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBEAQ8NFP9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBEAQ8NFP9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms