Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMBQ6PCB8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms