Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGO2Q562F6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms