Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.067e-21■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.197e-21■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.347e-21■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.847e-11■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 POLR1A-210ENST00000496892 546 ntTSL 49.32□□□□□ -0.922e-7■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 POLR1A-209ENST00000492034 588 ntTSL 49.32□□□□□ -0.922e-7■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-7■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.422e-7■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 SNTB1-204ENST00000519298 414 ntTSL 33.91□□□□□ -1.782e-7■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 SLC26A6-218ENST00000482282 1029 ntTSL 59□□□□□ -0.972e-8■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-14■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 SLC2A4RG-207ENST00000493772 1328 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.441e-14■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 SLC2A4RG-202ENST00000473157 991 ntTSL 310.98□□□□□ -0.651e-14■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 SLC2A4RG-208ENST00000496425 502 ntTSL 210.69□□□□□ -0.71e-14■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 CHRD-203ENST00000356534 1252 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.47e-9■■□□□ 14.1
SRSF9Q13242 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 29.62□□□□□ -0.871e-6■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 214.62□□□□□ -0.071e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 210.47□□□□□ -0.731e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 PLXNB1-217ENST00000484485 560 ntTSL 411.22□□□□□ -0.611e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-226ENST00000494621 871 ntTSL 311.2□□□□□ -0.622e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZDHHC8-207ENST00000472497 909 ntTSL 210.91□□□□□ -0.661e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.721e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-206ENST00000437658 931 ntTSL 210.34□□□□□ -0.752e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.821e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-213ENST00000466330 746 ntTSL 39.28□□□□□ -0.922e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-212ENST00000464375 626 ntTSL 38.92□□□□□ -0.982e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 38.88□□□□□ -0.991e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZDHHC8-206ENST00000469212 625 ntTSL 38.88□□□□□ -0.991e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-216ENST00000475743 590 ntTSL 48.86□□□□□ -0.992e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-214ENST00000466975 560 ntTSL 48.27□□□□□ -1.092e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-205ENST00000417778 760 ntTSL 38.05□□□□□ -1.122e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-209ENST00000455226 585 ntTSL 47.27□□□□□ -1.252e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-207ENST00000454122 731 ntTSL 37.01□□□□□ -1.292e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-208ENST00000454278 595 ntTSL 46.88□□□□□ -1.312e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-220ENST00000487707 592 ntTSL 36.46□□□□□ -1.382e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.642e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.962e-14■■□□□ 14
SRSF9Q13242 AL121845.2-202ENST00000476221 446 ntTSL 510.99□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 14
SRSF9Q13242 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-6■■□□□ 14
SRSF9Q13242 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 23.97□□□□□ -1.771e-26■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-8■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.741e-8■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.741e-8■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.891e-8■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.081e-8■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.078e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.028e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.238e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.518e-7■■□□□ 14
SRSF9Q13242 MLXIPL-207ENST00000453275 690 ntTSL 512.14□□□□□ -0.471e-10■■□□□ 14
SRSF9Q13242 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-10■■□□□ 14
SRSF9Q13242 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.661e-10■■□□□ 14
SRSF9Q13242 MLXIPL-210ENST00000476404 1921 ntTSL 210.9□□□□□ -0.671e-10■■□□□ 14
SRSF9Q13242 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.71e-10■■□□□ 14
SRSF9Q13242 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-10■■□□□ 14
SRSF9Q13242 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-10■■□□□ 14
SRSF9Q13242 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.81e-10■■□□□ 14
SRSF9Q13242 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.354e-6■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.094e-6■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-9■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 TAF1C-202ENST00000537450 1318 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-9■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 TAF1C-206ENST00000562330 1044 ntTSL 311.33□□□□□ -0.62e-9■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 TAF1C-213ENST00000565279 912 ntTSL 510.41□□□□□ -0.742e-9■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 TAF1C-205ENST00000561955 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.31□□□□□ -0.762e-9■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 TAF1C-220ENST00000569505 564 ntTSL 39.75□□□□□ -0.852e-9■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.454e-10■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.654e-10■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.94e-10■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.924e-10■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 AKAP1-217ENST00000576295 614 ntTSL 38.87□□□□□ -0.994e-10■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.014e-10■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 AKAP1-203ENST00000481416 4089 ntTSL 58.09□□□□□ -1.114e-10■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 AKAP1-204ENST00000539273 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.174e-10■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 PAH-212ENST00000551337 675 ntTSL 311.98□□□□□ -0.495e-7■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.065e-7■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.55e-7■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 35.25□□□□□ -1.575e-7■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 PAH-207ENST00000549111 1252 ntTSL 1 (best)5.15□□□□□ -1.595e-7■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 PAH-210ENST00000550978 652 ntTSL 23.26□□□□□ -1.895e-7■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 QRICH2-203ENST00000524722 2253 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.852e-6■■□□□ 13.9
SRSF9Q13242 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.482e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.29e-9■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.479e-9■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.849e-9■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.899e-9■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.863e-14■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.953e-14■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 FGFR1OP-205ENST00000494781 460 ntTSL 37.48□□□□□ -1.213e-14■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.253e-14■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.753e-14■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 510.79□□□□□ -0.682e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 29.58□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 29.1□□□□□ -0.952e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 48.74□□□□□ -1.012e-7■■□□□ 13.8
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