Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 RIM15YFL033C 5313 nt5.54□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 IMA2YOL157C 1770 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 ARO10YDR380W 1908 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 DPB2YPR175W 2070 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 YJU2YKL095W 837 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 SEN34YAR008W 828 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 GEP5YLR091W 882 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 RDL2YOR286W 450 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 ATG7YHR171W 1893 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 CRZ1YNL027W 2037 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 YNL247WYNL247W 2304 nt5.53□□□□□ -1.52
RUP1Q12242 HXT3YDR345C 1704 nt5.52□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 SPO7YAL009W 780 nt5.52□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 RNR3YIL066C 2610 nt5.51□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 TOM20YGR082W 552 nt5.51□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 YBL044WYBL044W 369 nt5.51□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 RPS9AYPL081W 594 nt5.51□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 YPL102CYPL102C 303 nt5.51□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 MRK1YDL079C 1506 nt5.51□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 VPS72YDR485C 2388 nt5.5□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 SHP1YBL058W 1272 nt5.5□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 MTQ1YNL063W 945 nt5.5□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 RPO26YPR187W 468 nt5.5□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 SIP5YMR140W 1470 nt5.5□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 MRF1YGL143C 1242 nt5.49□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 NCS6YGL211W 1080 nt5.49□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 RPS15YOL040C 429 nt5.49□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 GPT2YKR067W 2232 nt5.49□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 VHS1YDR247W 1386 nt5.49□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 ATE1YGL017W 1512 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 BUL1YMR275C 2931 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 SNT2YGL131C 4212 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 TEL2YGR099W 2067 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 NQM1YGR043C 1002 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 JJJ3YJR097W 519 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 PUF3YLL013C 2640 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 GLE1YDL207W 1617 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 SMF3YLR034C 1422 nt5.48□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 GLT1YDL171C 6438 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 CHL4YDR254W 1377 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 YDL121CYDL121C 450 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 RML2YEL050C 1182 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 COS6YGR295C 1146 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 ERP5YHR110W 639 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 YLR122CYLR122C 378 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 SPG4YMR107W 348 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 ATG18YFR021W 1503 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 ALT1YLR089C 1779 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 AVO1YOL078W 3531 nt5.47□□□□□ -1.53
RUP1Q12242 RRP4YHR069C 1080 nt5.46□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 APS3YJL024C 585 nt5.46□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 SNO4YMR322C 714 nt5.46□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 HSP33YOR391C 714 nt5.46□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 HSP32YPL280W 714 nt5.46□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 EIS1YMR031C 2532 nt5.46□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 RRN3YKL125W 1884 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 TKL1YPR074C 2043 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 AIM17YHL021C 1398 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 BPL1YDL141W 2073 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YDL114WYDL114W 927 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 GCS1YDL226C 1059 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 SNN1YNL086W 309 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 OXP1YKL215C 3861 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 DBF4YDR052C 2115 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 SRP101YDR292C 1866 nt5.45□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 SNF11YDR073W 510 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 SIT1YEL065W 1887 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YGL072CYGL072C 360 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 MTW1YAL034W-A 870 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 FOL1YNL256W 2475 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 COX11YPL132W 903 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 BIT2YBR270C 1638 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 SUB2YDL084W 1341 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 ECM7YLR443W 1347 nt5.44□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 ACF2YLR144C 2340 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 DUG1YFR044C 1446 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 FAT3YKL187C 2253 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YCL065WYCL065W 369 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 CDC10YCR002C 969 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YEA6YEL006W 1008 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YHR140WYHR140W 720 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YOR200WYOR200W 399 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 SLT2YHR030C 1455 nt5.43□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YOR1YGR281W 4434 nt5.42□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 GDB1YPR184W 4611 nt5.42□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 EGD2YHR193C 525 nt5.42□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 DOM34YNL001W 1161 nt5.42□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.42□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 UTP7YER082C 1665 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 FET3YMR058W 1911 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 MTQ2YDR140W 666 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YRA1YDR381W 681 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 PAN6YIL145C 930 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 YNL108CYNL108C 813 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 CSG2YBR036C 1233 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 HAL1YPR005C 885 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 BRF1YGR246C 1791 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 DAK1YML070W 1755 nt5.41□□□□□ -1.54
RUP1Q12242 SYG1YIL047C 2709 nt5.41□□□□□ -1.54
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