Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 IMD1YAR073W 1212 nt6.27□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 AAP1YHR047C 2571 nt6.27□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 MDH3YDL078C 1032 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 SHO1YER118C 1104 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YLR126CYLR126C 756 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 REC114YMR133W 1287 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YNL017CYNL017C 339 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 SUE1YPR151C 621 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 SET5YHR207C 1581 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 PAP2YOL115W 1755 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 BPL1YDL141W 2073 nt6.26□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 QRI1YDL103C 1434 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 VPS1YKR001C 2115 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 KIP2YPL155C 2121 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 SIT4YDL047W 936 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 MPM1YJL066C 759 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YJL107CYJL107C 1164 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YPL277CYPL277C 1464 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YHR045WYHR045W 1683 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 GEP3YOR205C 1671 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 MAL11YGR289C 1851 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 GFA1YKL104C 2154 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 RPT1YKL145W 1404 nt6.25□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 CTS1YLR286C 1689 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 PPR1YLR014C 2715 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YDL034WYDL034W 345 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 FYV1YDR024W 486 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 CTR3YLR411W 726 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 STE50YCL032W 1041 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 HAP1YLR256W 4509 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 EHD3YDR036C 1503 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 PUF3YLL013C 2640 nt6.24□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YDR154CYDR154C 351 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 RPS19BYNL302C 435 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 GPM3YOL056W 912 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YOR024WYOR024W 324 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 PIN2YOR104W 849 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 SCO1YBR037C 888 nt6.23□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YDL121CYDL121C 450 nt6.22□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 BNS1YGR230W 414 nt6.22□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 ATG17YLR423C 1254 nt6.22□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 ARO7YPR060C 771 nt6.22□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 SLT2YHR030C 1455 nt6.22□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 DFG5YMR238W 1377 nt6.21□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.21□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 XPT1YJR133W 630 nt6.21□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 ROX3YBL093C 663 nt6.21□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 ISU2YOR226C 471 nt6.21□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 YBR226CYBR226C 411 nt6.21□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 TAX4YJL083W 1815 nt6.2□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 RRP46YGR095C 672 nt6.2□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 FRE3YOR381W 2136 nt6.2□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 LYS21YDL131W 1323 nt6.2□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 ULA1YPL003W 1389 nt6.19□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 RGT1YKL038W 3513 nt6.19□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 YDL144CYDL144C 1071 nt6.19□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 COX26YDR119W-A 201 nt6.19□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 YLL059CYLL059C 507 nt6.19□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 snR10snR10 245 nt6.19□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 COX11YPL132W 903 nt6.19□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 NOT3YIL038C 2511 nt6.19□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt6.18□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 TIF2YJL138C 1188 nt6.18□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 TIF1YKR059W 1188 nt6.18□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 RPA49YNL248C 1248 nt6.18□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 VMA13YPR036W 1437 nt6.17□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 SCW4YGR279C 1161 nt6.17□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 RDL2YOR286W 450 nt6.17□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 PDI1YCL043C 1569 nt6.17□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 CDC16YKL022C 2523 nt6.17□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 SIP5YMR140W 1470 nt6.16□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 SNU71YGR013W 1863 nt6.16□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 RRN3YKL125W 1884 nt6.16□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.16□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 GAL83YER027C 1254 nt6.15□□□□□ -1.42
LSP1Q12230 CUE2YKL090W 1332 nt6.15□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 APM2YHL019C 1818 nt6.15□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 TAH18YPR048W 1872 nt6.14□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 YER187WYER187W 426 nt6.14□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 GTO1YGR154C 1071 nt6.14□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 LST8YNL006W 912 nt6.14□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 BUB3YOR026W 1026 nt6.14□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 PUS1YPL212C 1635 nt6.14□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 FET3YMR058W 1911 nt6.13□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 PHO86YJL117W 936 nt6.13□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 COS9YKL219W 1224 nt6.13□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 DCI1YOR180C 816 nt6.13□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 MCH4YOL119C 1506 nt6.13□□□□□ -1.43
LSP1Q12230 AAD4YDL243C 990 nt6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms