Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 PCL6YER059W 1263 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 GTO1YGR154C 1071 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 ECM14YHR132C 1293 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 DAL2YIR029W 1032 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 YIF1YNL263C 945 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 GPI2YPL076W 843 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 IDI1YPL117C 867 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 OMS1YDR316W 1416 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 ALT1YLR089C 1779 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 NOP2YNL061W 1857 nt5.54□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 CSC1YLR241W 2349 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 ADE12YNL220W 1302 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 AVO1YOL078W 3531 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 COX20YDR231C 618 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 YLF2YHL014C 1218 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 DCD1YHR144C 939 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 GAT4YIR013C 366 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 POP5YAL033W 522 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 RPF2YKR081C 1035 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 PCD1YLR151C 1023 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 EDE1YBL047C 4146 nt5.53□□□□□ -1.52
MSL5Q12186 YDR132CYDR132C 1488 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RIO1YOR119C 1455 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YML133CYML133C 4125 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YKR015CYKR015C 1707 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YDL121CYDL121C 450 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 SHR3YDL212W 633 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YFT2YDR319C 825 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 COG7YGL005C 840 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YIL086CYIL086C 309 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 TFB6YOR352W 1032 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 SNT309YPR101W 528 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RPO26YPR187W 468 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 UTP4YDR324C 2331 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 HEM1YDR232W 1647 nt5.52□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YDR222WYDR222W 1248 nt5.51□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 ARI1YGL157W 1044 nt5.51□□□□□ -1.53 RIP-Chip
MSL5Q12186 YGR168CYGR168C 1131 nt5.51□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 SAY1YGR263C 1275 nt5.51□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 SNO4YMR322C 714 nt5.51□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 VPS68YOL129W 555 nt5.51□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 HSP33YOR391C 714 nt5.51□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 HSP32YPL280W 714 nt5.51□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 SEC18YBR080C 2277 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 AMD2YDR242W 1650 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YCR041WYCR041W 333 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 OCA4YCR095C 1089 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YEA6YEL006W 1008 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 CBP4YGR174C 513 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 DAL3YIR032C 588 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 MPM1YJL066C 759 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 ELC1YPL046C 300 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YPL068CYPL068C 882 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 DAP1YPL170W 459 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 HAL1YPR005C 885 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RRP15YPR143W 753 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 POP4YBR257W 840 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 FOB1YDR110W 1701 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 UTP9YHR196W 1728 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 BZZ1YHR114W 1902 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 MIF2YKL089W 1650 nt5.5□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RMD8YFR048W 1989 nt5.49□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RSA4YCR072C 1548 nt5.49□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YDR336WYDR336W 945 nt5.49□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YML090WYML090W 387 nt5.49□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YNL120CYNL120C 486 nt5.49□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 YSA1YBR111C 696 nt5.49□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 ATG32YIL146C 1590 nt5.49□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 SIT1YEL065W 1887 nt5.49□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 PAP1YKR002W 1707 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 CCZ1YBR131W 2115 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 SCT1YBL011W 2280 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 NUP84YDL116W 2181 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 GRX6YDL010W 696 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 MRPL25YGR076C 474 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 AIM23YJL131C 1071 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 COX17YLL009C 210 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 PNP1YLR209C 936 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 MFA2YNL145W 117 nt5.48□□□□□ -1.53
MSL5Q12186 THI80YOR143C 960 nt5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11 ms