Protein–RNA interactions for Protein: Q08AN1

ZNF616, Zinc finger protein 616, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF616Q08AN1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF616Q08AN1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF616Q08AN1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms