Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PUDPQ08623 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms