Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MUC3AQ02505 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC3AQ02505 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms