Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 LDS1YAL018C 978 nt5.18□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YOL163WYOL163W 510 nt5.18□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 SCT1YBL011W 2280 nt5.18□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 VAN1YML115C 1608 nt5.18□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 TEP1YNL128W 1305 nt5.18□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 ECM3YOR092W 1842 nt5.18□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 STE12YHR084W 2067 nt5.17□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 ATR1YML116W 1629 nt5.17□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 MRPL25YGR076C 474 nt5.17□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RHO4YKR055W 876 nt5.17□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 ECM19YLR390W 339 nt5.17□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 TOM40YMR203W 1164 nt5.17□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.17□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 ALD6YPL061W 1503 nt5.17□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 GPA2YER020W 1350 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 NHA1YLR138W 2958 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RPS16BYDL083C 432 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YDL129WYDL129W 876 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RSM10YDR041W 612 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RRP1YDR087C 837 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 GTO1YGR154C 1071 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 HSP150YJL159W 1242 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 RRS1YOR294W 612 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 MPP10YJR002W 1782 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 GUA1YMR217W 1578 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 LAP2YNL045W 2016 nt5.16□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 VPS1YKR001C 2115 nt5.15□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 ABZ1YNR033W 2364 nt5.15□□□□□ -1.58
SKO1Q02100 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.15□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YGL235WYGL235W 537 nt5.15□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 HMT1YBR034C 1047 nt5.15□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 MRPS16YPL013C 366 nt5.15□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 REG2YBR050C 1017 nt5.15□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 VMA13YPR036W 1437 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 NUD1YOR373W 2556 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 UTP4YDR324C 2331 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 EPS1YIL005W 2106 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 IRC7YFR055W 1023 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 SPO12YHR152W 522 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 ENV9YOR246C 993 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YOR292CYOR292C 930 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 DBP9YLR276C 1785 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 MUM3YOR298W 1440 nt5.14□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 GIP2YER054C 1647 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 FAA4YMR246W 2085 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 MNS1YJR131W 1650 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YEL068CYEL068C 333 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 UBC6YER100W 753 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 TAL1YLR354C 1008 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 GTR1YML121W 933 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 MDM31YHR194W 1740 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 IML2YJL082W 2196 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 WHI2YOR043W 1461 nt5.13□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 KKQ8YKL168C 2175 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 AAD6YFL056C 639 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YLR126CYLR126C 756 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 TSA1YML028W 591 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 PDR16YNL231C 1056 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YPL014WYPL014W 1146 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 GIP1YBR045C 1920 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YJR124CYJR124C 1347 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YMD8YML038C 1329 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 ADE12YNL220W 1302 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 FRS2YFL022C 1512 nt5.12□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 HOF1YMR032W 2010 nt5.11□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YDL144CYDL144C 1071 nt5.11□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 PRS2YER099C 957 nt5.11□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 CTR2YHR175W 570 nt5.11□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 SEC13YLR208W 894 nt5.11□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 NOP13YNL175C 1212 nt5.11□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YPL102CYPL102C 303 nt5.11□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 GCR2YNL199C 1605 nt5.11□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 RPT3YDR394W 1287 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 YDR541CYDR541C 1035 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 RAD3YER171W 2337 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 GAT1YFL021W 1533 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 FMP48YGR052W 1110 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 TNA1YGR260W 1605 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 LEU5YHR002W 1074 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 RPL10YLR075W 666 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 SHP1YBL058W 1272 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 CPA1YOR303W 1236 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 UBA1YKL210W 3075 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 HSP104YLL026W 2727 nt5.1□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 PRI2YKL045W 1587 nt5.09□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 ORC5YNL261W 1440 nt5.09□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 ATG1YGL180W 2694 nt5.09□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 SNM1YDR478W 597 nt5.09□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 IPI1YHR085W 1005 nt5.09□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 EGD2YHR193C 525 nt5.09□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.09□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.09□□□□□ -1.59
SKO1Q02100 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms