Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS4XP62701 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4XP62701 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms