Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	WTM2	YOR229W	1404 nt		5.63	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	HPF1	YOL155C	2904 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	OSW2	YLR054C	2175 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YDR053W	YDR053W	396 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	MRF1	YGL143C	1242 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	DJP1	YIR004W	1299 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	RPR2	YIR015W	435 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YMR252C	YMR252C	405 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	COX11	YPL132W	903 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	ADE13	YLR359W	1449 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	VMA13	YPR036W	1437 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	KCH1	YJR054W	1494 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	GIT1	YCR098C	1557 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	AFT1	YGL071W	2073 nt		5.62	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	PHB1	YGR132C	864 nt		5.61	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	STE20	YHL007C	2820 nt		5.61	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	TDH2	YJR009C	999 nt		5.61	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	ASK1	YKL052C	879 nt		5.61	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	STM1	YLR150W	822 nt		5.61	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	CDC1	YDR182W	1476 nt		5.6	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YEL077C	YEL077C	3834 nt		5.6	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YHR218W-A	YHR218W-A	318 nt		5.6	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	LYS12	YIL094C	1116 nt		5.6	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	AIM20	YIL158W	615 nt		5.6	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YBL112C	YBL112C	318 nt		5.6	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	IES1	YFL013C	2079 nt		5.59	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	SIT4	YDL047W	936 nt		5.59	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YDL218W	YDL218W	954 nt		5.59	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	HVG1	YER039C	750 nt		5.59	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YKL031W	YKL031W	414 nt		5.59	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	CBT1	YKL208W	816 nt		5.59	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YKR073C	YKR073C	321 nt		5.59	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	BLM10	YFL007W	6432 nt		5.59	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	CAX4	YGR036C	720 nt		5.58	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YHR213W-A	YHR213W-A	234 nt		5.58	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	DOM34	YNL001W	1161 nt		5.58	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	QDR3	YBR043C	2070 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	PEX19	YDL065C	1029 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	MSP1	YGR028W	1089 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	LEU5	YHR002W	1074 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	POR2	YIL114C	846 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YMR295C	YMR295C	594 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YNL285W	YNL285W	372 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	SCS22	YBL091C-A	528 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	PSH1	YOL054W	1221 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	APM4	YOL062C	1476 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	CNM67	YNL225C	1746 nt		5.57	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	SEC9	YGR009C	1956 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	PDC1	YLR044C	1692 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	RPT2	YDL007W	1314 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YDL129W	YDL129W	876 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YHR140W	YHR140W	720 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	SFC1	YJR095W	969 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	GFD1	YMR255W	567 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	JNM1	YMR294W	1122 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YNL042W-B	YNL042W-B	258 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	TOS3	YGL179C	1683 nt		5.56	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	MSS116	YDR194C	1995 nt		5.55	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.55	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	PPG1	YNR032W	1107 nt		5.55	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YDR109C	YDR109C	2148 nt		5.54	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	CDC10	YCR002C	969 nt		5.54	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	CIN4	YMR138W	576 nt		5.54	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	APE3	YBR286W	1614 nt		5.54	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.53	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YIL060W	YIL060W	435 nt		5.53	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	YPL062W	YPL062W	405 nt		5.53	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	MLC2	YPR188C	492 nt		5.53	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	GRS1	YBR121C	2004 nt		5.53	□□□□□ -1.52
DSL1	P53847	DPB2	YPR175W	2070 nt		5.52	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	GYP1	YOR070C	1914 nt		5.52	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YER010C	YER010C	705 nt		5.52	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YER084W	YER084W	387 nt		5.52	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	RPT6	YGL048C	1218 nt		5.52	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	OCA1	YNL099C	717 nt		5.52	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	CDS1	YBR029C	1374 nt		5.52	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	MKC7	YDR144C	1791 nt		5.52	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	DBF2	YGR092W	1719 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YML082W	YML082W	1950 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	FET3	YMR058W	1911 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	APL6	YGR261C	2430 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	RPS5	YJR123W	678 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YKR041W	YKR041W	753 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YOR111W	YOR111W	699 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	PEX32	YBR168W	1242 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YHR182W	YHR182W	2358 nt		5.51	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	ADE6	YGR061C	4077 nt		5.5	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	ECT1	YGR007W	972 nt		5.5	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	BUB3	YOR026W	1026 nt		5.5	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	RBD2	YPL246C	789 nt		5.5	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	PAP1	YKR002W	1707 nt		5.5	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	DSF1	YEL070W	1509 nt		5.49	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YNR073C	YNR073C	1509 nt		5.49	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	ARO10	YDR380W	1908 nt		5.49	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	ERP5	YHR110W	639 nt		5.49	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	GAS3	YMR215W	1575 nt		5.49	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	NOC4	YPR144C	1659 nt		5.49	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	SSZ1	YHR064C	1617 nt		5.48	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	RRP9	YPR137W	1722 nt		5.48	□□□□□ -1.53

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