Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX2-5P52952 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms