Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YNL247WYNL247W 2304 nt6.44□□□□□ -1.38
VID28P40547 DEF1YKL054C 2217 nt6.44□□□□□ -1.38
VID28P40547 SNF11YDR073W 510 nt6.44□□□□□ -1.38
VID28P40547 YHP1YDR451C 1062 nt6.44□□□□□ -1.38
VID28P40547 CHO1YER026C 831 nt6.44□□□□□ -1.38
VID28P40547 RAI1YGL246C 1164 nt6.44□□□□□ -1.38
VID28P40547 MRP17YKL003C 396 nt6.44□□□□□ -1.38
VID28P40547 MTC2YKL098W 1074 nt6.44□□□□□ -1.38
VID28P40547 SKG1YKR100C 1068 nt6.43□□□□□ -1.38
VID28P40547 MRPL22YNL177C 930 nt6.43□□□□□ -1.38
VID28P40547 ODC2YOR222W 924 nt6.43□□□□□ -1.38
VID28P40547 TIP41YPR040W 1071 nt6.43□□□□□ -1.38
VID28P40547 ENT2YLR206W 1842 nt6.43□□□□□ -1.38
VID28P40547 PTK2YJR059W 2457 nt6.42□□□□□ -1.38
VID28P40547 AMA1YGR225W 1782 nt6.42□□□□□ -1.38
VID28P40547 VPS72YDR485C 2388 nt6.42□□□□□ -1.38
VID28P40547 PTR2YKR093W 1806 nt6.42□□□□□ -1.38
VID28P40547 RSC30YHR056C 2652 nt6.42□□□□□ -1.38
VID28P40547 MMS2YGL087C 414 nt6.42□□□□□ -1.38
VID28P40547 LSG1YGL099W 1923 nt6.42□□□□□ -1.38
VID28P40547 BZZ1YHR114W 1902 nt6.42□□□□□ -1.38
VID28P40547 RET1YOR207C 3450 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 YDL119CYDL119C 924 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 JJJ3YJR097W 519 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 HSF1YGL073W 2502 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 ACF2YLR144C 2340 nt6.41□□□□□ -1.38
VID28P40547 RSC2YLR357W 2670 nt6.4□□□□□ -1.38
VID28P40547 SHE10YGL228W 1734 nt6.4□□□□□ -1.38
VID28P40547 YGR022CYGR022C 330 nt6.4□□□□□ -1.38
VID28P40547 MAD2YJL030W 591 nt6.4□□□□□ -1.38
VID28P40547 CDC11YJR076C 1248 nt6.4□□□□□ -1.38
VID28P40547 DCN1YLR128W 810 nt6.4□□□□□ -1.38
VID28P40547 YLR317WYLR317W 435 nt6.4□□□□□ -1.38
VID28P40547 AIM17YHL021C 1398 nt6.4□□□□□ -1.39
VID28P40547 NMT1YLR195C 1368 nt6.4□□□□□ -1.39
VID28P40547 GPA1YHR005C 1419 nt6.4□□□□□ -1.39
VID28P40547 SPO12YHR152W 522 nt6.39□□□□□ -1.39
VID28P40547 YIL077CYIL077C 963 nt6.39□□□□□ -1.39
VID28P40547 HCR1YLR192C 798 nt6.39□□□□□ -1.39
VID28P40547 PFA3YNL326C 1011 nt6.39□□□□□ -1.39
VID28P40547 RPS15YOL040C 429 nt6.39□□□□□ -1.39
VID28P40547 YMR027WYMR027W 1413 nt6.39□□□□□ -1.39
VID28P40547 YEF1YEL041W 1488 nt6.39□□□□□ -1.39
VID28P40547 TRK2YKR050W 2670 nt6.38□□□□□ -1.39
VID28P40547 SRG1SRG1 551 nt6.38□□□□□ -1.39
VID28P40547 GTO1YGR154C 1071 nt6.38□□□□□ -1.39
VID28P40547 HSP150YJL159W 1242 nt6.38□□□□□ -1.39
VID28P40547 RRT7YLL030C 342 nt6.38□□□□□ -1.39
VID28P40547 PGA3YML125C 939 nt6.38□□□□□ -1.39
VID28P40547 YNL234WYNL234W 1281 nt6.38□□□□□ -1.39
VID28P40547 UGO1YDR470C 1509 nt6.38□□□□□ -1.39
VID28P40547 SKN1YGR143W 2316 nt6.37□□□□□ -1.39
VID28P40547 GUF1YLR289W 1938 nt6.37□□□□□ -1.39
VID28P40547 YJU2YKL095W 837 nt6.37□□□□□ -1.39
VID28P40547 RDL1YOR285W 420 nt6.37□□□□□ -1.39
VID28P40547 GPT2YKR067W 2232 nt6.37□□□□□ -1.39
VID28P40547 ARH1YDR376W 1482 nt6.36□□□□□ -1.39
VID28P40547 CBP4YGR174C 513 nt6.36□□□□□ -1.39
VID28P40547 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.36□□□□□ -1.39
VID28P40547 SPC42YKL042W 1092 nt6.36□□□□□ -1.39
VID28P40547 PEX12YMR026C 1200 nt6.36□□□□□ -1.39
VID28P40547 HEM15YOR176W 1182 nt6.36□□□□□ -1.39
VID28P40547 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.36□□□□□ -1.39
VID28P40547 CDC19YAL038W 1503 nt6.35□□□□□ -1.39
VID28P40547 SAC6YDR129C 1929 nt6.35□□□□□ -1.39
VID28P40547 BAP2YBR068C 1830 nt6.35□□□□□ -1.39
VID28P40547 YEL074WYEL074W 339 nt6.35□□□□□ -1.39
VID28P40547 MRPL36YBR122C 534 nt6.35□□□□□ -1.39
VID28P40547 UTP7YER082C 1665 nt6.34□□□□□ -1.39
VID28P40547 YDL023CYDL023C 321 nt6.34□□□□□ -1.39
VID28P40547 YDL034WYDL034W 345 nt6.34□□□□□ -1.39
VID28P40547 COX26YDR119W-A 201 nt6.34□□□□□ -1.39
VID28P40547 RPR2YIR015W 435 nt6.34□□□□□ -1.39
VID28P40547 SFC1YJR095W 969 nt6.34□□□□□ -1.39
VID28P40547 YFR006WYFR006W 1608 nt6.34□□□□□ -1.39
VID28P40547 GEX1YCL073C 1848 nt6.34□□□□□ -1.4
VID28P40547 GEX2YKR106W 1848 nt6.34□□□□□ -1.4
VID28P40547 MCM6YGL201C 3054 nt6.34□□□□□ -1.4
VID28P40547 PMT2YAL023C 2280 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 CLD1YGR110W 1338 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 DBR1YKL149C 1218 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 YET2YMR040W 483 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 ELA1YNL230C 1140 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 MED4YOR174W 855 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 snR34snR34 203 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 YEL020CYEL020C 1683 nt6.33□□□□□ -1.4
VID28P40547 ISR1YPR106W 1332 nt6.32□□□□□ -1.4
VID28P40547 MRPL25YGR076C 474 nt6.32□□□□□ -1.4
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