Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA2P29317 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms