Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5AP20339 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms