Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
CUX2O14529 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CUX2O14529 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CUX2O14529 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CUX2O14529 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CUX2O14529 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CUX2O14529 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CUX2O14529 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CUX2O14529 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CUX2O14529 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CUX2O14529 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CUX2O14529 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CUX2O14529 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CUX2O14529 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CUX2O14529 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CUX2O14529 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CUX2O14529 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CUX2O14529 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CUX2O14529 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
CUX2O14529 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CUX2O14529 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CUX2O14529 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CUX2O14529 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CUX2O14529 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CUX2O14529 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CUX2O14529 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CUX2O14529 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CUX2O14529 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CUX2O14529 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CUX2O14529 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CUX2O14529 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CUX2O14529 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
CUX2O14529 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CUX2O14529 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CUX2O14529 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CUX2O14529 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CUX2O14529 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CUX2O14529 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CUX2O14529 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CUX2O14529 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CUX2O14529 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CUX2O14529 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CUX2O14529 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CUX2O14529 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CUX2O14529 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
CUX2O14529 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CUX2O14529 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CUX2O14529 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CUX2O14529 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CUX2O14529 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CUX2O14529 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CUX2O14529 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CUX2O14529 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CUX2O14529 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CUX2O14529 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CUX2O14529 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CUX2O14529 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CUX2O14529 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CUX2O14529 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CUX2O14529 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CUX2O14529 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CUX2O14529 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CUX2O14529 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
CUX2O14529 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CUX2O14529 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CUX2O14529 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CUX2O14529 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CUX2O14529 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
CUX2O14529 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CUX2O14529 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CUX2O14529 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CUX2O14529 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CUX2O14529 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CUX2O14529 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CUX2O14529 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
CUX2O14529 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CUX2O14529 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CUX2O14529 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CUX2O14529 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CUX2O14529 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CUX2O14529 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CUX2O14529 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CUX2O14529 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CUX2O14529 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CUX2O14529 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CUX2O14529 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CUX2O14529 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CUX2O14529 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
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