Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPDC1A2A3K4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPDC1A2A3K4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms