Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rsph9Q9D9V4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Rsph9Q9D9V4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Rsph9Q9D9V4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Rsph9Q9D9V4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Rsph9Q9D9V4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Rsph9Q9D9V4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Rsph9Q9D9V4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rsph9Q9D9V4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rsph9Q9D9V4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Rsph9Q9D9V4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rsph9Q9D9V4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rsph9Q9D9V4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rsph9Q9D9V4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rsph9Q9D9V4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rsph9Q9D9V4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rsph9Q9D9V4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rsph9Q9D9V4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Rsph9Q9D9V4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rsph9Q9D9V4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rsph9Q9D9V4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rsph9Q9D9V4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rsph9Q9D9V4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Rsph9Q9D9V4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Rsph9Q9D9V4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rsph9Q9D9V4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rsph9Q9D9V4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Rsph9Q9D9V4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Rsph9Q9D9V4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rsph9Q9D9V4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Rsph9Q9D9V4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rsph9Q9D9V4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rsph9Q9D9V4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rsph9Q9D9V4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Rsph9Q9D9V4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Rsph9Q9D9V4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Rsph9Q9D9V4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Rsph9Q9D9V4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Rsph9Q9D9V4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Rsph9Q9D9V4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rsph9Q9D9V4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Rsph9Q9D9V4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rsph9Q9D9V4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rsph9Q9D9V4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Rsph9Q9D9V4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Rsph9Q9D9V4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Rsph9Q9D9V4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Rsph9Q9D9V4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Rsph9Q9D9V4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Rsph9Q9D9V4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Rsph9Q9D9V4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Rsph9Q9D9V4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Rsph9Q9D9V4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Rsph9Q9D9V4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rsph9Q9D9V4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rsph9Q9D9V4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rsph9Q9D9V4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rsph9Q9D9V4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Rsph9Q9D9V4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rsph9Q9D9V4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Rsph9Q9D9V4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,2■■□□□ 1,79
Rsph9Q9D9V4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rsph9Q9D9V4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Rsph9Q9D9V4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rsph9Q9D9V4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Rsph9Q9D9V4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rsph9Q9D9V4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rsph9Q9D9V4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rsph9Q9D9V4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rsph9Q9D9V4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Rsph9Q9D9V4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rsph9Q9D9V4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rsph9Q9D9V4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rsph9Q9D9V4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rsph9Q9D9V4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Rsph9Q9D9V4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rsph9Q9D9V4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rsph9Q9D9V4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rsph9Q9D9V4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Rsph9Q9D9V4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rsph9Q9D9V4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rsph9Q9D9V4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rsph9Q9D9V4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rsph9Q9D9V4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rsph9Q9D9V4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rsph9Q9D9V4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rsph9Q9D9V4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Rsph9Q9D9V4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rsph9Q9D9V4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rsph9Q9D9V4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rsph9Q9D9V4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms