Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SncbQ91ZZ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SncbQ91ZZ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SncbQ91ZZ3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SncbQ91ZZ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SncbQ91ZZ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SncbQ91ZZ3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SncbQ91ZZ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SncbQ91ZZ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SncbQ91ZZ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SncbQ91ZZ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SncbQ91ZZ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SncbQ91ZZ3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SncbQ91ZZ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SncbQ91ZZ3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SncbQ91ZZ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SncbQ91ZZ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SncbQ91ZZ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SncbQ91ZZ3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SncbQ91ZZ3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SncbQ91ZZ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SncbQ91ZZ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SncbQ91ZZ3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SncbQ91ZZ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SncbQ91ZZ3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SncbQ91ZZ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SncbQ91ZZ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SncbQ91ZZ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SncbQ91ZZ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SncbQ91ZZ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SncbQ91ZZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SncbQ91ZZ3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SncbQ91ZZ3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SncbQ91ZZ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SncbQ91ZZ3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SncbQ91ZZ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SncbQ91ZZ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SncbQ91ZZ3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SncbQ91ZZ3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SncbQ91ZZ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SncbQ91ZZ3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SncbQ91ZZ3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SncbQ91ZZ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SncbQ91ZZ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SncbQ91ZZ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SncbQ91ZZ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SncbQ91ZZ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SncbQ91ZZ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SncbQ91ZZ3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SncbQ91ZZ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SncbQ91ZZ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SncbQ91ZZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SncbQ91ZZ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SncbQ91ZZ3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SncbQ91ZZ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SncbQ91ZZ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SncbQ91ZZ3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SncbQ91ZZ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SncbQ91ZZ3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SncbQ91ZZ3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SncbQ91ZZ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SncbQ91ZZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SncbQ91ZZ3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SncbQ91ZZ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SncbQ91ZZ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SncbQ91ZZ3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SncbQ91ZZ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SncbQ91ZZ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SncbQ91ZZ3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SncbQ91ZZ3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SncbQ91ZZ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SncbQ91ZZ3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SncbQ91ZZ3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SncbQ91ZZ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SncbQ91ZZ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SncbQ91ZZ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SncbQ91ZZ3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SncbQ91ZZ3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SncbQ91ZZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SncbQ91ZZ3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SncbQ91ZZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms