Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfxn3Q91V61 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfxn3Q91V61 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sfxn3Q91V61 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfxn3Q91V61 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sfxn3Q91V61 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfxn3Q91V61 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfxn3Q91V61 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sfxn3Q91V61 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfxn3Q91V61 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfxn3Q91V61 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfxn3Q91V61 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfxn3Q91V61 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfxn3Q91V61 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfxn3Q91V61 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfxn3Q91V61 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfxn3Q91V61 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfxn3Q91V61 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfxn3Q91V61 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfxn3Q91V61 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfxn3Q91V61 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sfxn3Q91V61 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfxn3Q91V61 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfxn3Q91V61 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfxn3Q91V61 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfxn3Q91V61 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfxn3Q91V61 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfxn3Q91V61 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfxn3Q91V61 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfxn3Q91V61 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sfxn3Q91V61 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfxn3Q91V61 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfxn3Q91V61 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfxn3Q91V61 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfxn3Q91V61 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfxn3Q91V61 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfxn3Q91V61 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfxn3Q91V61 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sfxn3Q91V61 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sfxn3Q91V61 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sfxn3Q91V61 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfxn3Q91V61 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfxn3Q91V61 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfxn3Q91V61 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfxn3Q91V61 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfxn3Q91V61 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfxn3Q91V61 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfxn3Q91V61 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfxn3Q91V61 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfxn3Q91V61 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfxn3Q91V61 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Sfxn3Q91V61 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfxn3Q91V61 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfxn3Q91V61 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfxn3Q91V61 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sfxn3Q91V61 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfxn3Q91V61 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfxn3Q91V61 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfxn3Q91V61 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfxn3Q91V61 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfxn3Q91V61 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfxn3Q91V61 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfxn3Q91V61 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfxn3Q91V61 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfxn3Q91V61 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfxn3Q91V61 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sfxn3Q91V61 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfxn3Q91V61 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfxn3Q91V61 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfxn3Q91V61 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfxn3Q91V61 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfxn3Q91V61 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfxn3Q91V61 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfxn3Q91V61 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfxn3Q91V61 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sfxn3Q91V61 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfxn3Q91V61 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfxn3Q91V61 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sfxn3Q91V61 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfxn3Q91V61 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfxn3Q91V61 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfxn3Q91V61 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfxn3Q91V61 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfxn3Q91V61 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfxn3Q91V61 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfxn3Q91V61 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfxn3Q91V61 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Sfxn3Q91V61 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfxn3Q91V61 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfxn3Q91V61 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms