Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mcfd2Q8K5B2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcfd2Q8K5B2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcfd2Q8K5B2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcfd2Q8K5B2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcfd2Q8K5B2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcfd2Q8K5B2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcfd2Q8K5B2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcfd2Q8K5B2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcfd2Q8K5B2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcfd2Q8K5B2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcfd2Q8K5B2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcfd2Q8K5B2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcfd2Q8K5B2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mcfd2Q8K5B2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcfd2Q8K5B2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcfd2Q8K5B2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcfd2Q8K5B2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcfd2Q8K5B2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcfd2Q8K5B2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcfd2Q8K5B2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcfd2Q8K5B2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcfd2Q8K5B2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcfd2Q8K5B2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcfd2Q8K5B2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcfd2Q8K5B2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcfd2Q8K5B2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcfd2Q8K5B2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcfd2Q8K5B2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcfd2Q8K5B2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcfd2Q8K5B2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcfd2Q8K5B2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcfd2Q8K5B2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcfd2Q8K5B2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcfd2Q8K5B2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcfd2Q8K5B2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcfd2Q8K5B2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcfd2Q8K5B2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcfd2Q8K5B2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcfd2Q8K5B2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcfd2Q8K5B2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcfd2Q8K5B2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcfd2Q8K5B2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcfd2Q8K5B2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcfd2Q8K5B2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcfd2Q8K5B2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcfd2Q8K5B2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcfd2Q8K5B2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcfd2Q8K5B2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcfd2Q8K5B2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcfd2Q8K5B2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcfd2Q8K5B2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcfd2Q8K5B2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcfd2Q8K5B2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcfd2Q8K5B2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcfd2Q8K5B2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcfd2Q8K5B2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcfd2Q8K5B2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcfd2Q8K5B2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcfd2Q8K5B2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcfd2Q8K5B2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcfd2Q8K5B2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcfd2Q8K5B2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcfd2Q8K5B2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcfd2Q8K5B2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mcfd2Q8K5B2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcfd2Q8K5B2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcfd2Q8K5B2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mcfd2Q8K5B2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcfd2Q8K5B2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mcfd2Q8K5B2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mcfd2Q8K5B2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mcfd2Q8K5B2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mcfd2Q8K5B2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcfd2Q8K5B2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcfd2Q8K5B2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcfd2Q8K5B2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcfd2Q8K5B2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcfd2Q8K5B2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcfd2Q8K5B2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mcfd2Q8K5B2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcfd2Q8K5B2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcfd2Q8K5B2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcfd2Q8K5B2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcfd2Q8K5B2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcfd2Q8K5B2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcfd2Q8K5B2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.8 ms