Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema3bQ62177 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema3bQ62177 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3bQ62177 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema3bQ62177 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3bQ62177 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3bQ62177 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3bQ62177 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema3bQ62177 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3bQ62177 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema3bQ62177 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema3bQ62177 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema3bQ62177 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3bQ62177 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3bQ62177 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3bQ62177 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema3bQ62177 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema3bQ62177 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3bQ62177 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3bQ62177 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3bQ62177 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3bQ62177 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema3bQ62177 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema3bQ62177 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema3bQ62177 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3bQ62177 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3bQ62177 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema3bQ62177 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema3bQ62177 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sema3bQ62177 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema3bQ62177 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema3bQ62177 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema3bQ62177 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema3bQ62177 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema3bQ62177 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema3bQ62177 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema3bQ62177 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema3bQ62177 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema3bQ62177 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema3bQ62177 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema3bQ62177 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema3bQ62177 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema3bQ62177 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema3bQ62177 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema3bQ62177 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema3bQ62177 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema3bQ62177 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema3bQ62177 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3bQ62177 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema3bQ62177 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3bQ62177 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3bQ62177 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3bQ62177 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3bQ62177 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3bQ62177 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3bQ62177 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3bQ62177 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema3bQ62177 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema3bQ62177 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema3bQ62177 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3bQ62177 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3bQ62177 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3bQ62177 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3bQ62177 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3bQ62177 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3bQ62177 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3bQ62177 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3bQ62177 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3bQ62177 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3bQ62177 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3bQ62177 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3bQ62177 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3bQ62177 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema3bQ62177 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema3bQ62177 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema3bQ62177 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema3bQ62177 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3bQ62177 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema3bQ62177 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema3bQ62177 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema3bQ62177 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema3bQ62177 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema3bQ62177 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema3bQ62177 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema3bQ62177 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema3bQ62177 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema3bQ62177 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema3bQ62177 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema3bQ62177 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema3bQ62177 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema3bQ62177 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3bQ62177 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms