Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cacna1eQ61290 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cacna1eQ61290 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacna1eQ61290 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacna1eQ61290 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1eQ61290 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1eQ61290 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna1eQ61290 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacna1eQ61290 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna1eQ61290 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cacna1eQ61290 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1eQ61290 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1eQ61290 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacna1eQ61290 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1eQ61290 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna1eQ61290 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1eQ61290 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna1eQ61290 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1eQ61290 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna1eQ61290 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna1eQ61290 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cacna1eQ61290 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cacna1eQ61290 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1eQ61290 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1eQ61290 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1eQ61290 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1eQ61290 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna1eQ61290 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1eQ61290 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna1eQ61290 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacna1eQ61290 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna1eQ61290 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacna1eQ61290 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1eQ61290 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna1eQ61290 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna1eQ61290 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1eQ61290 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna1eQ61290 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna1eQ61290 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cacna1eQ61290 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1eQ61290 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1eQ61290 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna1eQ61290 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1eQ61290 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna1eQ61290 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna1eQ61290 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacna1eQ61290 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna1eQ61290 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1eQ61290 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna1eQ61290 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacna1eQ61290 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1eQ61290 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna1eQ61290 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacna1eQ61290 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna1eQ61290 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna1eQ61290 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna1eQ61290 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna1eQ61290 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1eQ61290 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1eQ61290 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1eQ61290 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1eQ61290 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1eQ61290 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna1eQ61290 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1eQ61290 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1eQ61290 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1eQ61290 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Cacna1eQ61290 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1eQ61290 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1eQ61290 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1eQ61290 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacna1eQ61290 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna1eQ61290 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1eQ61290 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1eQ61290 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1eQ61290 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1eQ61290 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1eQ61290 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna1eQ61290 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna1eQ61290 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna1eQ61290 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna1eQ61290 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms