Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctf1Q60753 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctf1Q60753 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctf1Q60753 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctf1Q60753 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctf1Q60753 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctf1Q60753 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctf1Q60753 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctf1Q60753 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctf1Q60753 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctf1Q60753 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctf1Q60753 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctf1Q60753 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctf1Q60753 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctf1Q60753 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctf1Q60753 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctf1Q60753 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctf1Q60753 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctf1Q60753 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctf1Q60753 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctf1Q60753 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctf1Q60753 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctf1Q60753 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctf1Q60753 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctf1Q60753 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctf1Q60753 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctf1Q60753 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctf1Q60753 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctf1Q60753 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctf1Q60753 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctf1Q60753 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctf1Q60753 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctf1Q60753 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctf1Q60753 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctf1Q60753 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctf1Q60753 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctf1Q60753 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctf1Q60753 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctf1Q60753 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctf1Q60753 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctf1Q60753 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctf1Q60753 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctf1Q60753 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctf1Q60753 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctf1Q60753 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctf1Q60753 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctf1Q60753 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctf1Q60753 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctf1Q60753 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctf1Q60753 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctf1Q60753 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctf1Q60753 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctf1Q60753 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctf1Q60753 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctf1Q60753 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctf1Q60753 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctf1Q60753 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctf1Q60753 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctf1Q60753 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms