Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AY761185Q5ERI8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AY761185Q5ERI8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AY761185Q5ERI8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AY761185Q5ERI8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AY761185Q5ERI8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AY761185Q5ERI8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AY761185Q5ERI8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AY761185Q5ERI8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AY761185Q5ERI8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AY761185Q5ERI8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
AY761185Q5ERI8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AY761185Q5ERI8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AY761185Q5ERI8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AY761185Q5ERI8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AY761185Q5ERI8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AY761185Q5ERI8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AY761185Q5ERI8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AY761185Q5ERI8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AY761185Q5ERI8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AY761185Q5ERI8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AY761185Q5ERI8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AY761185Q5ERI8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AY761185Q5ERI8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AY761185Q5ERI8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AY761185Q5ERI8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AY761185Q5ERI8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AY761185Q5ERI8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AY761185Q5ERI8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AY761185Q5ERI8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AY761185Q5ERI8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AY761185Q5ERI8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AY761185Q5ERI8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AY761185Q5ERI8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AY761185Q5ERI8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AY761185Q5ERI8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AY761185Q5ERI8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AY761185Q5ERI8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AY761185Q5ERI8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AY761185Q5ERI8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AY761185Q5ERI8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AY761185Q5ERI8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AY761185Q5ERI8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AY761185Q5ERI8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AY761185Q5ERI8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AY761185Q5ERI8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AY761185Q5ERI8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AY761185Q5ERI8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AY761185Q5ERI8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AY761185Q5ERI8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AY761185Q5ERI8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AY761185Q5ERI8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AY761185Q5ERI8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AY761185Q5ERI8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AY761185Q5ERI8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AY761185Q5ERI8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AY761185Q5ERI8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AY761185Q5ERI8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AY761185Q5ERI8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AY761185Q5ERI8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AY761185Q5ERI8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AY761185Q5ERI8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AY761185Q5ERI8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AY761185Q5ERI8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AY761185Q5ERI8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AY761185Q5ERI8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AY761185Q5ERI8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AY761185Q5ERI8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AY761185Q5ERI8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AY761185Q5ERI8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms