Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
AY761185Q5ERI8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,71■■□□□ 1,71
AY761185Q5ERI8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
AY761185Q5ERI8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
AY761185Q5ERI8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
AY761185Q5ERI8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
AY761185Q5ERI8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
AY761185Q5ERI8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
AY761185Q5ERI8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
AY761185Q5ERI8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
AY761185Q5ERI8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,45■■□□□ 1,67
AY761185Q5ERI8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
AY761185Q5ERI8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
AY761185Q5ERI8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
AY761185Q5ERI8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
AY761185Q5ERI8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,38■■□□□ 1,65
AY761185Q5ERI8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
AY761185Q5ERI8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
AY761185Q5ERI8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
AY761185Q5ERI8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
AY761185Q5ERI8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
AY761185Q5ERI8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
AY761185Q5ERI8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
AY761185Q5ERI8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
AY761185Q5ERI8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AY761185Q5ERI8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
AY761185Q5ERI8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,19■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,18■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
AY761185Q5ERI8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
AY761185Q5ERI8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
AY761185Q5ERI8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,05■■□□□ 1,6
AY761185Q5ERI8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
AY761185Q5ERI8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,04■■□□□ 1,6
AY761185Q5ERI8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
AY761185Q5ERI8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1,59
AY761185Q5ERI8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
AY761185Q5ERI8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
AY761185Q5ERI8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
AY761185Q5ERI8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
AY761185Q5ERI8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
AY761185Q5ERI8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
AY761185Q5ERI8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
AY761185Q5ERI8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
AY761185Q5ERI8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
AY761185Q5ERI8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
AY761185Q5ERI8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
AY761185Q5ERI8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
AY761185Q5ERI8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,76■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
AY761185Q5ERI8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,54
AY761185Q5ERI8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,68■■□□□ 1,54
AY761185Q5ERI8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
AY761185Q5ERI8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
AY761185Q5ERI8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
AY761185Q5ERI8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
AY761185Q5ERI8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,62■■□□□ 1,53
AY761185Q5ERI8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
AY761185Q5ERI8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
AY761185Q5ERI8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
AY761185Q5ERI8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
AY761185Q5ERI8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
AY761185Q5ERI8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
AY761185Q5ERI8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
AY761185Q5ERI8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
AY761185Q5ERI8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24,46■■□□□ 1,51
AY761185Q5ERI8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,45■■□□□ 1,5
AY761185Q5ERI8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
AY761185Q5ERI8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
AY761185Q5ERI8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
AY761185Q5ERI8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,41■■□□□ 1,5
AY761185Q5ERI8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
AY761185Q5ERI8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,6 ms