Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Col24a1Q30D77 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Col24a1Q30D77 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col24a1Q30D77 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col24a1Q30D77 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Col24a1Q30D77 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Col24a1Q30D77 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Col24a1Q30D77 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Col24a1Q30D77 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Col24a1Q30D77 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col24a1Q30D77 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Col24a1Q30D77 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Col24a1Q30D77 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Col24a1Q30D77 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Col24a1Q30D77 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Col24a1Q30D77 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Col24a1Q30D77 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Col24a1Q30D77 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Col24a1Q30D77 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Col24a1Q30D77 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Col24a1Q30D77 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Col24a1Q30D77 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Col24a1Q30D77 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Col24a1Q30D77 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Col24a1Q30D77 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Col24a1Q30D77 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Col24a1Q30D77 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Col24a1Q30D77 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Col24a1Q30D77 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Col24a1Q30D77 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Col24a1Q30D77 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Col24a1Q30D77 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Col24a1Q30D77 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Col24a1Q30D77 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Col24a1Q30D77 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Col24a1Q30D77 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col24a1Q30D77 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col24a1Q30D77 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col24a1Q30D77 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Col24a1Q30D77 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Col24a1Q30D77 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Col24a1Q30D77 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Col24a1Q30D77 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Col24a1Q30D77 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col24a1Q30D77 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col24a1Q30D77 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Col24a1Q30D77 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Col24a1Q30D77 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Col24a1Q30D77 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Col24a1Q30D77 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Col24a1Q30D77 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Col24a1Q30D77 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Col24a1Q30D77 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Col24a1Q30D77 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Col24a1Q30D77 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Col24a1Q30D77 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Col24a1Q30D77 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Col24a1Q30D77 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Col24a1Q30D77 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Col24a1Q30D77 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Col24a1Q30D77 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Col24a1Q30D77 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Col24a1Q30D77 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Col24a1Q30D77 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Col24a1Q30D77 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Col24a1Q30D77 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Col24a1Q30D77 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Col24a1Q30D77 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col24a1Q30D77 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col24a1Q30D77 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Col24a1Q30D77 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Col24a1Q30D77 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col24a1Q30D77 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col24a1Q30D77 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col24a1Q30D77 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Col24a1Q30D77 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col24a1Q30D77 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Col24a1Q30D77 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Col24a1Q30D77 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Col24a1Q30D77 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Col24a1Q30D77 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col24a1Q30D77 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col24a1Q30D77 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Col24a1Q30D77 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Col24a1Q30D77 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Col24a1Q30D77 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Col24a1Q30D77 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Col24a1Q30D77 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Col24a1Q30D77 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Col24a1Q30D77 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms