Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Col24a1Q30D77 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Col24a1Q30D77 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Col24a1Q30D77 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Col24a1Q30D77 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Col24a1Q30D77 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Col24a1Q30D77 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Col24a1Q30D77 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Col24a1Q30D77 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Col24a1Q30D77 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Col24a1Q30D77 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Col24a1Q30D77 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Col24a1Q30D77 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Col24a1Q30D77 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Col24a1Q30D77 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Col24a1Q30D77 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Col24a1Q30D77 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Col24a1Q30D77 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Col24a1Q30D77 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Col24a1Q30D77 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,72■■■□□ 2,99
Col24a1Q30D77 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Col24a1Q30D77 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Col24a1Q30D77 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Col24a1Q30D77 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Col24a1Q30D77 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Col24a1Q30D77 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Col24a1Q30D77 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Col24a1Q30D77 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Col24a1Q30D77 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Col24a1Q30D77 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Col24a1Q30D77 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Col24a1Q30D77 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
Col24a1Q30D77 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Col24a1Q30D77 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Col24a1Q30D77 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Col24a1Q30D77 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Col24a1Q30D77 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Col24a1Q30D77 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Col24a1Q30D77 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Col24a1Q30D77 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Col24a1Q30D77 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Col24a1Q30D77 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Col24a1Q30D77 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Col24a1Q30D77 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Col24a1Q30D77 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Col24a1Q30D77 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Col24a1Q30D77 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Col24a1Q30D77 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Col24a1Q30D77 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Col24a1Q30D77 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Col24a1Q30D77 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Col24a1Q30D77 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
Col24a1Q30D77 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Col24a1Q30D77 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Col24a1Q30D77 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,05■■■□□ 2,88
Col24a1Q30D77 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Col24a1Q30D77 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Col24a1Q30D77 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Col24a1Q30D77 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Col24a1Q30D77 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Col24a1Q30D77 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Col24a1Q30D77 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Col24a1Q30D77 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Col24a1Q30D77 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Col24a1Q30D77 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,89■■■□□ 2,86
Col24a1Q30D77 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Col24a1Q30D77 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Col24a1Q30D77 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Col24a1Q30D77 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Col24a1Q30D77 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Col24a1Q30D77 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Col24a1Q30D77 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Col24a1Q30D77 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Col24a1Q30D77 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Col24a1Q30D77 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Col24a1Q30D77 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Col24a1Q30D77 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Col24a1Q30D77 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32,72■■■□□ 2,83
Col24a1Q30D77 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Col24a1Q30D77 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32,71■■■□□ 2,83
Col24a1Q30D77 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Col24a1Q30D77 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Col24a1Q30D77 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32,66■■■□□ 2,82
Col24a1Q30D77 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Col24a1Q30D77 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Col24a1Q30D77 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,81
Col24a1Q30D77 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,53■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32,53■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,51■■■□□ 2,8
Col24a1Q30D77 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Col24a1Q30D77 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Col24a1Q30D77 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,9 ms