Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 PPIL2-207ENST00000462188 1735 ntTSL 222.07■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 54.5
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WDR43Q15061 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 42.7
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WDR43Q15061 AL390334.1-202ENST00000553392 674 ntTSL 38.26□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 42.7
WDR43Q15061 AL390334.1-203ENST00000554904 569 ntTSL 44.39□□□□□ -1.716e-7■■■■■ 42.7
WDR43Q15061 ZHX1-204ENST00000517516 780 ntTSL 34.06□□□□□ -1.766e-7■■■■■ 42.7
WDR43Q15061 OPA1-214ENST00000482865 567 ntTSL 43.92□□□□□ -1.786e-7■■■■■ 42.7
WDR43Q15061 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.923e-10■■■■■ 42.3
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WDR43Q15061 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 516.57■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 42.1
WDR43Q15061 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 42.1
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WDR43Q15061 MIR663AHG-230ENST00000609012 708 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-26■■■■■ 41
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WDR43Q15061 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 40.6
WDR43Q15061 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 40.6
WDR43Q15061 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 40.6
WDR43Q15061 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 40.6
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