Protein–RNA interactions for Protein: Q12502

LDB19, Protein LDB19, yeastyeast

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB19Q12502 FMP45YDL222C 930 nt13.72□□□□□ -0.21
LDB19Q12502 BUD23YCR047C 828 nt13.7□□□□□ -0.22
LDB19Q12502 YGL188CYGL188C 174 nt13.69□□□□□ -0.22
LDB19Q12502 AI5_BETAQ0075 1065 nt13.68□□□□□ -0.22
LDB19Q12502 MRPL8YJL063C 717 nt13.65□□□□□ -0.22
LDB19Q12502 DSK2YMR276W 1122 nt13.63□□□□□ -0.23
LDB19Q12502 Q0182Q0182 405 nt13.62□□□□□ -0.23
LDB19Q12502 NAB2YGL122C 1578 nt13.62□□□□□ -0.23
LDB19Q12502 YCH1YGR203W 447 nt13.59□□□□□ -0.23
LDB19Q12502 FPR4YLR449W 1179 nt13.59□□□□□ -0.23
LDB19Q12502 YPR011CYPR011C 981 nt13.59□□□□□ -0.23
LDB19Q12502 INM2YDR287W 879 nt13.58□□□□□ -0.24
LDB19Q12502 Q0010Q0010 387 nt13.58□□□□□ -0.24
LDB19Q12502 AI3Q0060 1248 nt13.56□□□□□ -0.24
LDB19Q12502 YBL100CYBL100C 315 nt13.55□□□□□ -0.24
LDB19Q12502 YLR236CYLR236C 324 nt13.54□□□□□ -0.24
LDB19Q12502 IMP2'YIL154C 1041 nt13.53□□□□□ -0.24
LDB19Q12502 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt13.53□□□□□ -0.24
LDB19Q12502 DAL1YIR027C 1383 nt13.52□□□□□ -0.25
LDB19Q12502 TRM9YML014W 840 nt13.5□□□□□ -0.25
LDB19Q12502 ADO1YJR105W 1023 nt13.47□□□□□ -0.25
LDB19Q12502 SRN2YLR119W 642 nt13.47□□□□□ -0.25
LDB19Q12502 FIS1YIL065C 468 nt13.45□□□□□ -0.26
LDB19Q12502 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.44□□□□□ -0.26
LDB19Q12502 UBX6YJL048C 1191 nt13.42□□□□□ -0.26
LDB19Q12502 YCR099CYCR099C 468 nt13.41□□□□□ -0.26
LDB19Q12502 PHO4YFR034C 939 nt13.4□□□□□ -0.26
LDB19Q12502 FUN26YAL022C 1554 nt13.39□□□□□ -0.27
LDB19Q12502 ATP6Q0085 780 nt13.36□□□□□ -0.27
LDB19Q12502 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.36□□□□□ -0.27
LDB19Q12502 YEL076CYEL076C 651 nt13.36□□□□□ -0.27
LDB19Q12502 YLR464WYLR464W 651 nt13.36□□□□□ -0.27
LDB19Q12502 LPX1YOR084W 1164 nt13.29□□□□□ -0.28
LDB19Q12502 SPP1YPL138C 1062 nt13.29□□□□□ -0.28
LDB19Q12502 CCT6YDR188W 1641 nt13.27□□□□□ -0.29
LDB19Q12502 YJL152WYJL152W 360 nt13.24□□□□□ -0.29
LDB19Q12502 ARP10YDR106W 855 nt13.22□□□□□ -0.29
LDB19Q12502 ERV46YAL042W 1248 nt13.21□□□□□ -0.29
LDB19Q12502 RTG1YOL067C 534 nt13.21□□□□□ -0.29
LDB19Q12502 AIR1YIL079C 1083 nt13.2□□□□□ -0.3
LDB19Q12502 SIS1YNL007C 1059 nt13.2□□□□□ -0.3
LDB19Q12502 IDH1YNL037C 1083 nt13.17□□□□□ -0.3
LDB19Q12502 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.16□□□□□ -0.3
LDB19Q12502 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.16□□□□□ -0.3
LDB19Q12502 ALF1YNL148C 765 nt13.16□□□□□ -0.3
LDB19Q12502 YDR433WYDR433W 441 nt13.15□□□□□ -0.3
LDB19Q12502 PET20YPL159C 762 nt13.11□□□□□ -0.31
LDB19Q12502 YKR040CYKR040C 504 nt13.07□□□□□ -0.32
LDB19Q12502 HUA1YGR268C 597 nt13.04□□□□□ -0.32
LDB19Q12502 YDR094WYDR094W 336 nt13□□□□□ -0.33
LDB19Q12502 ARA2YMR041C 1008 nt12.99□□□□□ -0.33
LDB19Q12502 GBP2YCL011C 1284 nt12.98□□□□□ -0.33
LDB19Q12502 YPS1YLR120C 1710 nt12.96□□□□□ -0.33
LDB19Q12502 YDR095CYDR095C 411 nt12.95□□□□□ -0.34
LDB19Q12502 MXR2YCL033C 507 nt12.95□□□□□ -0.34
LDB19Q12502 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.93□□□□□ -0.34
LDB19Q12502 YNR068CYNR068C 819 nt12.93□□□□□ -0.34
LDB19Q12502 KTR3YBR205W 1215 nt12.92□□□□□ -0.34
LDB19Q12502 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.88□□□□□ -0.35
LDB19Q12502 snR78snR78 87 nt12.86□□□□□ -0.35
LDB19Q12502 TIR4YOR009W 1464 nt12.84□□□□□ -0.35
LDB19Q12502 YPL168WYPL168W 1293 nt12.83□□□□□ -0.36
LDB19Q12502 PHO92YDR374C 921 nt12.82□□□□□ -0.36
LDB19Q12502 NEM1YHR004C 1341 nt12.78□□□□□ -0.36
LDB19Q12502 UTP6YDR449C 1323 nt12.73□□□□□ -0.37
LDB19Q12502 TCD2YKL027W 1344 nt12.73□□□□□ -0.37
LDB19Q12502 RPP2AYOL039W 321 nt12.73□□□□□ -0.37
LDB19Q12502 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.73□□□□□ -0.37
LDB19Q12502 SKG1YKR100C 1068 nt12.72□□□□□ -0.37
LDB19Q12502 CAC2YML102W 1407 nt12.71□□□□□ -0.37
LDB19Q12502 ABZ2YMR289W 1125 nt12.71□□□□□ -0.37
LDB19Q12502 YLR122CYLR122C 378 nt12.7□□□□□ -0.38
LDB19Q12502 ART5YGR068C 1761 nt12.68□□□□□ -0.38
LDB19Q12502 YMR057CYMR057C 372 nt12.67□□□□□ -0.38
LDB19Q12502 YHL044WYHL044W 708 nt12.66□□□□□ -0.38
LDB19Q12502 PTH1YHR189W 573 nt12.65□□□□□ -0.38
LDB19Q12502 SBA1YKL117W 651 nt12.63□□□□□ -0.39
LDB19Q12502 FRD1YEL047C 1413 nt12.62□□□□□ -0.39
LDB19Q12502 YKL030WYKL030W 606 nt12.62□□□□□ -0.39
LDB19Q12502 RPM1RPM1 483 nt12.62□□□□□ -0.39
LDB19Q12502 PET9YBL030C 957 nt12.61□□□□□ -0.39
LDB19Q12502 AST1YBL069W 1290 nt12.61□□□□□ -0.39
LDB19Q12502 PTP1YDL230W 1008 nt12.6□□□□□ -0.39
LDB19Q12502 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.58□□□□□ -0.4
LDB19Q12502 MEP2YNL142W 1500 nt12.57□□□□□ -0.4
LDB19Q12502 GFD2YCL036W 1701 nt12.57□□□□□ -0.4
LDB19Q12502 YLR235CYLR235C 399 nt12.56□□□□□ -0.4
LDB19Q12502 URE2YNL229C 1065 nt12.54□□□□□ -0.4
LDB19Q12502 PAU16YKL224C 372 nt12.52□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 FAR3YMR052W 615 nt12.52□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 YCL042WYCL042W 360 nt12.52□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 DED1YOR204W 1815 nt12.51□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.51□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 SPT5YML010W 3192 nt12.51□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 STD1YOR047C 1335 nt12.5□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 LCB1YMR296C 1677 nt12.49□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 YDR008CYDR008C 351 nt12.47□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 RRD1YIL153W 1182 nt12.46□□□□□ -0.41
LDB19Q12502 RRT5YFR032C 870 nt12.43□□□□□ -0.42
LDB19Q12502 RTS2YOR077W 699 nt12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms