Protein–RNA interactions for Protein: Q12150

CSF1, Protein CSF1, yeastyeast

Predictions only

Length 2,958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSF1Q12150 TRM9YML014W 840 nt11.66□□□□□ -0.54
CSF1Q12150 ADO1YJR105W 1023 nt11.64□□□□□ -0.55
CSF1Q12150 ERV46YAL042W 1248 nt11.63□□□□□ -0.55
CSF1Q12150 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.63□□□□□ -0.55
CSF1Q12150 FPR4YLR449W 1179 nt11.63□□□□□ -0.55
CSF1Q12150 YDR094WYDR094W 336 nt11.59□□□□□ -0.55
CSF1Q12150 YJL152WYJL152W 360 nt11.59□□□□□ -0.55
CSF1Q12150 PHO4YFR034C 939 nt11.56□□□□□ -0.56
CSF1Q12150 IMP2'YIL154C 1041 nt11.56□□□□□ -0.56
CSF1Q12150 CCT6YDR188W 1641 nt11.53□□□□□ -0.56
CSF1Q12150 MXR2YCL033C 507 nt11.52□□□□□ -0.57
CSF1Q12150 FUN26YAL022C 1554 nt11.48□□□□□ -0.57
CSF1Q12150 DAL1YIR027C 1383 nt11.43□□□□□ -0.58
CSF1Q12150 INM2YDR287W 879 nt11.42□□□□□ -0.58
CSF1Q12150 SIS1YNL007C 1059 nt11.41□□□□□ -0.58
CSF1Q12150 YPS1YLR120C 1710 nt11.4□□□□□ -0.58
CSF1Q12150 HUA1YGR268C 597 nt11.38□□□□□ -0.59
CSF1Q12150 YDR433WYDR433W 441 nt11.37□□□□□ -0.59
CSF1Q12150 SBA1YKL117W 651 nt11.37□□□□□ -0.59
CSF1Q12150 IDH1YNL037C 1083 nt11.32□□□□□ -0.6
CSF1Q12150 YKR040CYKR040C 504 nt11.25□□□□□ -0.61
CSF1Q12150 GBP2YCL011C 1284 nt11.23□□□□□ -0.61
CSF1Q12150 TIR4YOR009W 1464 nt11.22□□□□□ -0.61
CSF1Q12150 DED1YOR204W 1815 nt11.2□□□□□ -0.62
CSF1Q12150 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.19□□□□□ -0.62
CSF1Q12150 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.19□□□□□ -0.62
CSF1Q12150 PAU16YKL224C 372 nt11.19□□□□□ -0.62
CSF1Q12150 PTH1YHR189W 573 nt11.18□□□□□ -0.62
CSF1Q12150 ART5YGR068C 1761 nt11.11□□□□□ -0.63
CSF1Q12150 PRE6YOL038W 765 nt11.11□□□□□ -0.63
CSF1Q12150 ALF1YNL148C 765 nt11.09□□□□□ -0.63
CSF1Q12150 CAC2YML102W 1407 nt11.02□□□□□ -0.64
CSF1Q12150 YLR235CYLR235C 399 nt11.02□□□□□ -0.65
CSF1Q12150 TCD2YKL027W 1344 nt11.02□□□□□ -0.65
CSF1Q12150 YFR018CYFR018C 1092 nt11□□□□□ -0.65
CSF1Q12150 YDR095CYDR095C 411 nt10.99□□□□□ -0.65
CSF1Q12150 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.99□□□□□ -0.65
CSF1Q12150 YMR057CYMR057C 372 nt10.99□□□□□ -0.65
CSF1Q12150 FRD1YEL047C 1413 nt10.99□□□□□ -0.65
CSF1Q12150 SPT5YML010W 3192 nt10.97□□□□□ -0.65
CSF1Q12150 LCB1YMR296C 1677 nt10.95□□□□□ -0.66
CSF1Q12150 RRD1YIL153W 1182 nt10.91□□□□□ -0.66
CSF1Q12150 GFD2YCL036W 1701 nt10.87□□□□□ -0.67
CSF1Q12150 RPP2AYOL039W 321 nt10.86□□□□□ -0.67
CSF1Q12150 FPS1YLL043W 2010 nt10.84□□□□□ -0.67
CSF1Q12150 YKL030WYKL030W 606 nt10.83□□□□□ -0.68
CSF1Q12150 FMT1YBL013W 1206 nt10.83□□□□□ -0.68
CSF1Q12150 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.83□□□□□ -0.68
CSF1Q12150 YFL066CYFL066C 1179 nt10.8□□□□□ -0.68
CSF1Q12150 RRT5YFR032C 870 nt10.8□□□□□ -0.68
CSF1Q12150 RTS2YOR077W 699 nt10.79□□□□□ -0.68
CSF1Q12150 YCL042WYCL042W 360 nt10.77□□□□□ -0.69
CSF1Q12150 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.76□□□□□ -0.69
CSF1Q12150 PET9YBL030C 957 nt10.73□□□□□ -0.69
CSF1Q12150 PTP1YDL230W 1008 nt10.72□□□□□ -0.69
CSF1Q12150 SOR2YDL246C 1074 nt10.7□□□□□ -0.7
CSF1Q12150 SOR1YJR159W 1074 nt10.7□□□□□ -0.7
CSF1Q12150 DIC1YLR348C 897 nt10.7□□□□□ -0.7
CSF1Q12150 DCW1YKL046C 1350 nt10.68□□□□□ -0.7
CSF1Q12150 SNF6YHL025W 999 nt10.68□□□□□ -0.7
CSF1Q12150 YLR179CYLR179C 606 nt10.67□□□□□ -0.7
CSF1Q12150 MEP2YNL142W 1500 nt10.66□□□□□ -0.7
CSF1Q12150 YPR064WYPR064W 420 nt10.6□□□□□ -0.71
CSF1Q12150 CWP1YKL096W 720 nt10.55□□□□□ -0.72
CSF1Q12150 TIM23YNR017W 669 nt10.53□□□□□ -0.72
CSF1Q12150 FMP52YER004W 696 nt10.52□□□□□ -0.73
CSF1Q12150 GIS3YLR094C 1509 nt10.47□□□□□ -0.73
CSF1Q12150 IRC15YPL017C 1500 nt10.45□□□□□ -0.74
CSF1Q12150 EMI2YDR516C 1503 nt10.45□□□□□ -0.74
CSF1Q12150 WSC2YNL283C 1512 nt10.44□□□□□ -0.74
CSF1Q12150 GLR1YPL091W 1452 nt10.43□□□□□ -0.74
CSF1Q12150 NAT4YMR069W 858 nt10.42□□□□□ -0.74
CSF1Q12150 YNL115CYNL115C 1935 nt10.4□□□□□ -0.74
CSF1Q12150 YMR244WYMR244W 1068 nt10.39□□□□□ -0.75
CSF1Q12150 PEX25YPL112C 1185 nt10.38□□□□□ -0.75
CSF1Q12150 CUE1YMR264W 612 nt10.38□□□□□ -0.75
CSF1Q12150 GLK1YCL040W 1503 nt10.37□□□□□ -0.75
CSF1Q12150 ADH2YMR303C 1047 nt10.36□□□□□ -0.75
CSF1Q12150 MIR1YJR077C 936 nt10.35□□□□□ -0.75
CSF1Q12150 MSF1YPR047W 1410 nt10.33□□□□□ -0.76
CSF1Q12150 YIH1YCR059C 777 nt10.32□□□□□ -0.76
CSF1Q12150 PCM1YEL058W 1674 nt10.3□□□□□ -0.76
CSF1Q12150 AHT1YHR093W 549 nt10.3□□□□□ -0.76
CSF1Q12150 TAD3YLR316C 969 nt10.29□□□□□ -0.76
CSF1Q12150 RAD51YER095W 1203 nt10.27□□□□□ -0.77
CSF1Q12150 YIL100WYIL100W 354 nt10.25□□□□□ -0.77
CSF1Q12150 ATF2YGR177C 1608 nt10.24□□□□□ -0.77
CSF1Q12150 YSC84YHR016C 1407 nt10.23□□□□□ -0.77
CSF1Q12150 BDH1YAL060W 1149 nt10.23□□□□□ -0.77
CSF1Q12150 YLL053CYLL053C 459 nt10.23□□□□□ -0.77
CSF1Q12150 SCC4YER147C 1875 nt10.23□□□□□ -0.77
CSF1Q12150 RRT12YCR045C 1476 nt10.2□□□□□ -0.78
CSF1Q12150 GAL1YBR020W 1587 nt10.19□□□□□ -0.78
CSF1Q12150 VPS75YNL246W 795 nt10.19□□□□□ -0.78
CSF1Q12150 RBG1YAL036C 1110 nt10.19□□□□□ -0.78
CSF1Q12150 RBG2YGR173W 1107 nt10.18□□□□□ -0.78
CSF1Q12150 NDI1YML120C 1542 nt10.18□□□□□ -0.78
CSF1Q12150 YDL221WYDL221W 552 nt10.16□□□□□ -0.78
CSF1Q12150 TRM5YHR070W 1500 nt10.16□□□□□ -0.78
CSF1Q12150 SDH1YKL148C 1923 nt10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms