Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 MRPL8YJL063C 717 nt16.09■□□□□ 0.17
SLM3Q12093 YJL152WYJL152W 360 nt15.98■□□□□ 0.15
SLM3Q12093 LPX1YOR084W 1164 nt15.98■□□□□ 0.15
SLM3Q12093 ALF1YNL148C 765 nt15.94■□□□□ 0.14
SLM3Q12093 SPP1YPL138C 1062 nt15.94■□□□□ 0.14
SLM3Q12093 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.93■□□□□ 0.14
SLM3Q12093 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.93■□□□□ 0.14
SLM3Q12093 ADO1YJR105W 1023 nt15.87■□□□□ 0.13
SLM3Q12093 ERV46YAL042W 1248 nt15.85■□□□□ 0.13
SLM3Q12093 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.84■□□□□ 0.13
SLM3Q12093 YEL076CYEL076C 651 nt15.84■□□□□ 0.13
SLM3Q12093 UBX6YJL048C 1191 nt15.84■□□□□ 0.13
SLM3Q12093 YLR464WYLR464W 651 nt15.84■□□□□ 0.13
SLM3Q12093 IDH1YNL037C 1083 nt15.82■□□□□ 0.12
SLM3Q12093 YDR433WYDR433W 441 nt15.79■□□□□ 0.12
SLM3Q12093 RTG1YOL067C 534 nt15.77■□□□□ 0.12
SLM3Q12093 SIS1YNL007C 1059 nt15.72■□□□□ 0.11
SLM3Q12093 YPS1YLR120C 1710 nt15.71■□□□□ 0.11
SLM3Q12093 YDR095CYDR095C 411 nt15.7■□□□□ 0.1
SLM3Q12093 YKR040CYKR040C 504 nt15.69■□□□□ 0.1
SLM3Q12093 GBP2YCL011C 1284 nt15.65■□□□□ 0.1
SLM3Q12093 TIR4YOR009W 1464 nt15.65■□□□□ 0.1
SLM3Q12093 MXR2YCL033C 507 nt15.64■□□□□ 0.09
SLM3Q12093 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.55■□□□□ 0.08
SLM3Q12093 HUA1YGR268C 597 nt15.46■□□□□ 0.07
SLM3Q12093 CAC2YML102W 1407 nt15.43■□□□□ 0.06
SLM3Q12093 YMR057CYMR057C 372 nt15.43■□□□□ 0.06
SLM3Q12093 ART5YGR068C 1761 nt15.42■□□□□ 0.06
SLM3Q12093 RPP2AYOL039W 321 nt15.42■□□□□ 0.06
SLM3Q12093 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.39■□□□□ 0.05
SLM3Q12093 YDR094WYDR094W 336 nt15.37■□□□□ 0.05
SLM3Q12093 TCD2YKL027W 1344 nt15.36■□□□□ 0.05
SLM3Q12093 PET9YBL030C 957 nt15.32■□□□□ 0.04
SLM3Q12093 PTP1YDL230W 1008 nt15.31■□□□□ 0.04
SLM3Q12093 GFD2YCL036W 1701 nt15.27■□□□□ 0.04
SLM3Q12093 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.27■□□□□ 0.04
SLM3Q12093 FRD1YEL047C 1413 nt15.25■□□□□ 0.03
SLM3Q12093 PTH1YHR189W 573 nt15.23■□□□□ 0.03
SLM3Q12093 DED1YOR204W 1815 nt15.22■□□□□ 0.03
SLM3Q12093 MEP2YNL142W 1500 nt15.16■□□□□ 0.02
SLM3Q12093 RRD1YIL153W 1182 nt15.15■□□□□ 0.02
SLM3Q12093 YKL030WYKL030W 606 nt15.1■□□□□ 0.01
SLM3Q12093 YCL042WYCL042W 360 nt15.09■□□□□ 0.01
SLM3Q12093 FPS1YLL043W 2010 nt15.09■□□□□ 0.01
SLM3Q12093 RTS2YOR077W 699 nt15.07■□□□□ 0
SLM3Q12093 YLR235CYLR235C 399 nt15.05■□□□□ -0
SLM3Q12093 FMT1YBL013W 1206 nt15.05■□□□□ -0
SLM3Q12093 LCB1YMR296C 1677 nt15.02□□□□□ -0.01
SLM3Q12093 DCW1YKL046C 1350 nt15.01□□□□□ -0.01
SLM3Q12093 SOR2YDL246C 1074 nt14.98□□□□□ -0.01
SLM3Q12093 SOR1YJR159W 1074 nt14.98□□□□□ -0.01
SLM3Q12093 SPT5YML010W 3192 nt14.96□□□□□ -0.01
SLM3Q12093 SBA1YKL117W 651 nt14.89□□□□□ -0.03
SLM3Q12093 PAU16YKL224C 372 nt14.88□□□□□ -0.03
SLM3Q12093 CWP1YKL096W 720 nt14.85□□□□□ -0.03
SLM3Q12093 CUE1YMR264W 612 nt14.85□□□□□ -0.03
SLM3Q12093 IRC15YPL017C 1500 nt14.85□□□□□ -0.03
SLM3Q12093 EMI2YDR516C 1503 nt14.82□□□□□ -0.04
SLM3Q12093 ADH2YMR303C 1047 nt14.78□□□□□ -0.04
SLM3Q12093 FMP52YER004W 696 nt14.77□□□□□ -0.05
SLM3Q12093 YFR018CYFR018C 1092 nt14.76□□□□□ -0.05
SLM3Q12093 TIM23YNR017W 669 nt14.76□□□□□ -0.05
SLM3Q12093 PRE6YOL038W 765 nt14.76□□□□□ -0.05
SLM3Q12093 YDL221WYDL221W 552 nt14.74□□□□□ -0.05
SLM3Q12093 RRT5YFR032C 870 nt14.74□□□□□ -0.05
SLM3Q12093 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.74□□□□□ -0.05
SLM3Q12093 GIS3YLR094C 1509 nt14.73□□□□□ -0.05
SLM3Q12093 DIC1YLR348C 897 nt14.69□□□□□ -0.06
SLM3Q12093 YIL100WYIL100W 354 nt14.68□□□□□ -0.06
SLM3Q12093 YLR179CYLR179C 606 nt14.66□□□□□ -0.06
SLM3Q12093 YMR090WYMR090W 684 nt14.6□□□□□ -0.07
SLM3Q12093 YPR064WYPR064W 420 nt14.59□□□□□ -0.07
SLM3Q12093 SNF6YHL025W 999 nt14.58□□□□□ -0.08
SLM3Q12093 PCM1YEL058W 1674 nt14.57□□□□□ -0.08
SLM3Q12093 TAD3YLR316C 969 nt14.53□□□□□ -0.08
SLM3Q12093 YFL066CYFL066C 1179 nt14.51□□□□□ -0.09
SLM3Q12093 WSC2YNL283C 1512 nt14.5□□□□□ -0.09
SLM3Q12093 RNQ1YCL028W 1218 nt14.48□□□□□ -0.09
SLM3Q12093 SCC4YER147C 1875 nt14.46□□□□□ -0.09
SLM3Q12093 YIH1YCR059C 777 nt14.44□□□□□ -0.1
SLM3Q12093 AHT1YHR093W 549 nt14.44□□□□□ -0.1
SLM3Q12093 SDH1YKL148C 1923 nt14.43□□□□□ -0.1
SLM3Q12093 NAT4YMR069W 858 nt14.37□□□□□ -0.11
SLM3Q12093 PEX25YPL112C 1185 nt14.37□□□□□ -0.11
SLM3Q12093 YLL053CYLL053C 459 nt14.31□□□□□ -0.12
SLM3Q12093 YBR220CYBR220C 1683 nt14.29□□□□□ -0.12
SLM3Q12093 YSC84YHR016C 1407 nt14.28□□□□□ -0.12
SLM3Q12093 BDH1YAL060W 1149 nt14.28□□□□□ -0.12
SLM3Q12093 YNL115CYNL115C 1935 nt14.28□□□□□ -0.12
SLM3Q12093 YSP3YOR003W 1437 nt14.27□□□□□ -0.12
SLM3Q12093 GLK1YCL040W 1503 nt14.26□□□□□ -0.13
SLM3Q12093 YNL195CYNL195C 786 nt14.26□□□□□ -0.13
SLM3Q12093 FTR1YER145C 1215 nt14.23□□□□□ -0.13
SLM3Q12093 BIO4YNR057C 714 nt14.22□□□□□ -0.13
SLM3Q12093 AQY1YPR192W 918 nt14.21□□□□□ -0.13
SLM3Q12093 GAL1YBR020W 1587 nt14.21□□□□□ -0.14
SLM3Q12093 RRT12YCR045C 1476 nt14.2□□□□□ -0.14
SLM3Q12093 YLR415CYLR415C 339 nt14.2□□□□□ -0.14
SLM3Q12093 MSF1YPR047W 1410 nt14.19□□□□□ -0.14
SLM3Q12093 TRM5YHR070W 1500 nt14.17□□□□□ -0.14
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