Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 DAL1YIR027C 1383 nt19.17■□□□□ 0.66
TY1B-LR1Q12088 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt19.15■□□□□ 0.66
TY1B-LR1Q12088 YEL076CYEL076C 651 nt19.15■□□□□ 0.66
TY1B-LR1Q12088 YLR464WYLR464W 651 nt19.15■□□□□ 0.66
TY1B-LR1Q12088 TRM9YML014W 840 nt19.15■□□□□ 0.66
TY1B-LR1Q12088 FUN26YAL022C 1554 nt19.13■□□□□ 0.65
TY1B-LR1Q12088 INM2YDR287W 879 nt19.11■□□□□ 0.65
TY1B-LR1Q12088 ADO1YJR105W 1023 nt19.07■□□□□ 0.64
TY1B-LR1Q12088 ERV46YAL042W 1248 nt19.07■□□□□ 0.64
TY1B-LR1Q12088 YJL152WYJL152W 360 nt19.04■□□□□ 0.64
TY1B-LR1Q12088 CCT6YDR188W 1641 nt18.99■□□□□ 0.63
TY1B-LR1Q12088 MXR2YCL033C 507 nt18.9■□□□□ 0.62
TY1B-LR1Q12088 SIS1YNL007C 1059 nt18.83■□□□□ 0.61
TY1B-LR1Q12088 IDH1YNL037C 1083 nt18.82■□□□□ 0.6
TY1B-LR1Q12088 YDR433WYDR433W 441 nt18.76■□□□□ 0.59
TY1B-LR1Q12088 YDR094WYDR094W 336 nt18.73■□□□□ 0.59
TY1B-LR1Q12088 ALF1YNL148C 765 nt18.73■□□□□ 0.59
TY1B-LR1Q12088 SUF2tP(AGG)C 72 nt18.72■□□□□ 0.59
TY1B-LR1Q12088 SUF10tP(AGG)N 72 nt18.72■□□□□ 0.59
TY1B-LR1Q12088 TIR4YOR009W 1464 nt18.71■□□□□ 0.59
TY1B-LR1Q12088 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt18.65■□□□□ 0.58
TY1B-LR1Q12088 GBP2YCL011C 1284 nt18.64■□□□□ 0.57
TY1B-LR1Q12088 YPS1YLR120C 1710 nt18.6■□□□□ 0.57
TY1B-LR1Q12088 YDR095CYDR095C 411 nt18.6■□□□□ 0.57
TY1B-LR1Q12088 YKR040CYKR040C 504 nt18.6■□□□□ 0.57
TY1B-LR1Q12088 PTH1YHR189W 573 nt18.5■□□□□ 0.55
TY1B-LR1Q12088 HUA1YGR268C 597 nt18.45■□□□□ 0.54
TY1B-LR1Q12088 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt18.32■□□□□ 0.52
TY1B-LR1Q12088 SBA1YKL117W 651 nt18.28■□□□□ 0.52
TY1B-LR1Q12088 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt18.26■□□□□ 0.51
TY1B-LR1Q12088 FRD1YEL047C 1413 nt18.25■□□□□ 0.51
TY1B-LR1Q12088 TCD2YKL027W 1344 nt18.24■□□□□ 0.51
TY1B-LR1Q12088 ART5YGR068C 1761 nt18.23■□□□□ 0.51
TY1B-LR1Q12088 CAC2YML102W 1407 nt18.21■□□□□ 0.51
TY1B-LR1Q12088 PAU16YKL224C 372 nt18.21■□□□□ 0.51
TY1B-LR1Q12088 YMR057CYMR057C 372 nt18.21■□□□□ 0.51
TY1B-LR1Q12088 GFD2YCL036W 1701 nt18.19■□□□□ 0.5
TY1B-LR1Q12088 DED1YOR204W 1815 nt18.15■□□□□ 0.5
TY1B-LR1Q12088 PRE6YOL038W 765 nt18.1■□□□□ 0.49
TY1B-LR1Q12088 RPP2AYOL039W 321 nt18.08■□□□□ 0.48
TY1B-LR1Q12088 PTP1YDL230W 1008 nt18.07■□□□□ 0.48
TY1B-LR1Q12088 RTS2YOR077W 699 nt18.07■□□□□ 0.48
TY1B-LR1Q12088 SOR2YDL246C 1074 nt18.03■□□□□ 0.48
TY1B-LR1Q12088 SOR1YJR159W 1074 nt18.03■□□□□ 0.48
TY1B-LR1Q12088 RRD1YIL153W 1182 nt18.02■□□□□ 0.48
TY1B-LR1Q12088 LCB1YMR296C 1677 nt17.99■□□□□ 0.47
TY1B-LR1Q12088 YLR235CYLR235C 399 nt17.96■□□□□ 0.47
TY1B-LR1Q12088 YKL030WYKL030W 606 nt17.94■□□□□ 0.46
TY1B-LR1Q12088 YCL042WYCL042W 360 nt17.93■□□□□ 0.46
TY1B-LR1Q12088 FMT1YBL013W 1206 nt17.92■□□□□ 0.46
TY1B-LR1Q12088 PET9YBL030C 957 nt17.91■□□□□ 0.46
TY1B-LR1Q12088 YFR018CYFR018C 1092 nt17.86■□□□□ 0.45
TY1B-LR1Q12088 FPS1YLL043W 2010 nt17.83■□□□□ 0.44
TY1B-LR1Q12088 DCW1YKL046C 1350 nt17.75■□□□□ 0.43
TY1B-LR1Q12088 TIM23YNR017W 669 nt17.71■□□□□ 0.43
TY1B-LR1Q12088 MEP2YNL142W 1500 nt17.68■□□□□ 0.42
TY1B-LR1Q12088 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt17.68■□□□□ 0.42
TY1B-LR1Q12088 CWP1YKL096W 720 nt17.61■□□□□ 0.41
TY1B-LR1Q12088 RRT5YFR032C 870 nt17.58■□□□□ 0.4
TY1B-LR1Q12088 DIC1YLR348C 897 nt17.56■□□□□ 0.4
TY1B-LR1Q12088 SNF6YHL025W 999 nt17.56■□□□□ 0.4
TY1B-LR1Q12088 CUE1YMR264W 612 nt17.56■□□□□ 0.4
TY1B-LR1Q12088 IRC15YPL017C 1500 nt17.54■□□□□ 0.4
TY1B-LR1Q12088 YLR179CYLR179C 606 nt17.54■□□□□ 0.4
TY1B-LR1Q12088 ADH2YMR303C 1047 nt17.52■□□□□ 0.4
TY1B-LR1Q12088 FMP52YER004W 696 nt17.45■□□□□ 0.38
TY1B-LR1Q12088 YFL066CYFL066C 1179 nt17.4■□□□□ 0.38
TY1B-LR1Q12088 EMI2YDR516C 1503 nt17.39■□□□□ 0.37
TY1B-LR1Q12088 YPR064WYPR064W 420 nt17.37■□□□□ 0.37
TY1B-LR1Q12088 WSC2YNL283C 1512 nt17.35■□□□□ 0.37
TY1B-LR1Q12088 PEX25YPL112C 1185 nt17.35■□□□□ 0.37
TY1B-LR1Q12088 SPT5YML010W 3192 nt17.26■□□□□ 0.35
TY1B-LR1Q12088 TAD3YLR316C 969 nt17.23■□□□□ 0.35
TY1B-LR1Q12088 YDL221WYDL221W 552 nt17.22■□□□□ 0.35
TY1B-LR1Q12088 YIL100WYIL100W 354 nt17.22■□□□□ 0.35
TY1B-LR1Q12088 GIS3YLR094C 1509 nt17.19■□□□□ 0.34
TY1B-LR1Q12088 NAT4YMR069W 858 nt17.16■□□□□ 0.34
TY1B-LR1Q12088 YIH1YCR059C 777 nt17.15■□□□□ 0.34
TY1B-LR1Q12088 GLK1YCL040W 1503 nt17.1■□□□□ 0.33
TY1B-LR1Q12088 PCM1YEL058W 1674 nt17.1■□□□□ 0.33
TY1B-LR1Q12088 YNL115CYNL115C 1935 nt17.09■□□□□ 0.33
TY1B-LR1Q12088 YSP3YOR003W 1437 nt17.06■□□□□ 0.32
TY1B-LR1Q12088 AHT1YHR093W 549 nt17.06■□□□□ 0.32
TY1B-LR1Q12088 MSF1YPR047W 1410 nt17.06■□□□□ 0.32
TY1B-LR1Q12088 MIR1YJR077C 936 nt17.05■□□□□ 0.32
TY1B-LR1Q12088 YSC84YHR016C 1407 nt17.03■□□□□ 0.32
TY1B-LR1Q12088 YLL053CYLL053C 459 nt17■□□□□ 0.31
TY1B-LR1Q12088 BDH1YAL060W 1149 nt16.98■□□□□ 0.31
TY1B-LR1Q12088 RNQ1YCL028W 1218 nt16.97■□□□□ 0.31
TY1B-LR1Q12088 YMR244WYMR244W 1068 nt16.95■□□□□ 0.3
TY1B-LR1Q12088 FTR1YER145C 1215 nt16.94■□□□□ 0.3
TY1B-LR1Q12088 BIO4YNR057C 714 nt16.92■□□□□ 0.3
TY1B-LR1Q12088 SDH1YKL148C 1923 nt16.91■□□□□ 0.3
TY1B-LR1Q12088 YLR415CYLR415C 339 nt16.9■□□□□ 0.3
TY1B-LR1Q12088 SCC4YER147C 1875 nt16.9■□□□□ 0.3
TY1B-LR1Q12088 THI74YDR438W 1113 nt16.83■□□□□ 0.28
TY1B-LR1Q12088 TRM5YHR070W 1500 nt16.82■□□□□ 0.28
TY1B-LR1Q12088 GLR1YPL091W 1452 nt16.8■□□□□ 0.28
TY1B-LR1Q12088 GAL1YBR020W 1587 nt16.79■□□□□ 0.28
TY1B-LR1Q12088 YMR090WYMR090W 684 nt16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms