Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Atf4Q06507 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Atf4Q06507 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Atf4Q06507 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Atf4Q06507 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Atf4Q06507 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Atf4Q06507 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Atf4Q06507 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Atf4Q06507 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Atf4Q06507 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Atf4Q06507 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Atf4Q06507 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Atf4Q06507 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Atf4Q06507 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Atf4Q06507 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Atf4Q06507 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Atf4Q06507 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Atf4Q06507 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Atf4Q06507 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Atf4Q06507 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Atf4Q06507 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Atf4Q06507 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Atf4Q06507 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Atf4Q06507 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Atf4Q06507 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Atf4Q06507 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Atf4Q06507 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Atf4Q06507 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Atf4Q06507 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atf4Q06507 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atf4Q06507 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atf4Q06507 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atf4Q06507 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atf4Q06507 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Atf4Q06507 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atf4Q06507 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Atf4Q06507 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atf4Q06507 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atf4Q06507 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atf4Q06507 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atf4Q06507 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atf4Q06507 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Atf4Q06507 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atf4Q06507 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atf4Q06507 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atf4Q06507 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atf4Q06507 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Atf4Q06507 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Atf4Q06507 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Atf4Q06507 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Atf4Q06507 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atf4Q06507 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atf4Q06507 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Atf4Q06507 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Atf4Q06507 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Atf4Q06507 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Atf4Q06507 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atf4Q06507 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atf4Q06507 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Atf4Q06507 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Atf4Q06507 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Atf4Q06507 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Atf4Q06507 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Atf4Q06507 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Atf4Q06507 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Atf4Q06507 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Atf4Q06507 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Atf4Q06507 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Atf4Q06507 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Atf4Q06507 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Atf4Q06507 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Atf4Q06507 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Atf4Q06507 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Atf4Q06507 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Atf4Q06507 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Atf4Q06507 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Atf4Q06507 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Atf4Q06507 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Atf4Q06507 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Atf4Q06507 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Atf4Q06507 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Atf4Q06507 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Atf4Q06507 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Atf4Q06507 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms