Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 SPP1YPL138C 1062 nt18.66■□□□□ 0.58
PDR12Q02785 IMP2'YIL154C 1041 nt18.64■□□□□ 0.58
PDR12Q02785 UBX6YJL048C 1191 nt18.63■□□□□ 0.57
PDR12Q02785 YJL152WYJL152W 360 nt18.57■□□□□ 0.56
PDR12Q02785 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt18.54■□□□□ 0.56
PDR12Q02785 YEL076CYEL076C 651 nt18.54■□□□□ 0.56
PDR12Q02785 YLR464WYLR464W 651 nt18.54■□□□□ 0.56
PDR12Q02785 CCT6YDR188W 1641 nt18.5■□□□□ 0.55
PDR12Q02785 ADO1YJR105W 1023 nt18.49■□□□□ 0.55
PDR12Q02785 RTG1YOL067C 534 nt18.44■□□□□ 0.54
PDR12Q02785 ERV46YAL042W 1248 nt18.4■□□□□ 0.54
PDR12Q02785 YDR433WYDR433W 441 nt18.36■□□□□ 0.53
PDR12Q02785 IDH1YNL037C 1083 nt18.36■□□□□ 0.53
PDR12Q02785 ALF1YNL148C 765 nt18.35■□□□□ 0.53
PDR12Q02785 SUF2tP(AGG)C 72 nt18.29■□□□□ 0.52
PDR12Q02785 SUF10tP(AGG)N 72 nt18.29■□□□□ 0.52
PDR12Q02785 MXR2YCL033C 507 nt18.27■□□□□ 0.51
PDR12Q02785 SIS1YNL007C 1059 nt18.22■□□□□ 0.51
PDR12Q02785 TIR4YOR009W 1464 nt18.14■□□□□ 0.49
PDR12Q02785 GBP2YCL011C 1284 nt18.13■□□□□ 0.49
PDR12Q02785 YKR040CYKR040C 504 nt18.08■□□□□ 0.48
PDR12Q02785 YPS1YLR120C 1710 nt18.04■□□□□ 0.48
PDR12Q02785 YDR095CYDR095C 411 nt18.03■□□□□ 0.48
PDR12Q02785 YDR094WYDR094W 336 nt18.01■□□□□ 0.47
PDR12Q02785 HUA1YGR268C 597 nt17.98■□□□□ 0.47
PDR12Q02785 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt17.93■□□□□ 0.46
PDR12Q02785 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt17.87■□□□□ 0.45
PDR12Q02785 PTH1YHR189W 573 nt17.87■□□□□ 0.45
PDR12Q02785 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt17.87■□□□□ 0.45
PDR12Q02785 TCD2YKL027W 1344 nt17.77■□□□□ 0.44
PDR12Q02785 YMR057CYMR057C 372 nt17.74■□□□□ 0.43
PDR12Q02785 ART5YGR068C 1761 nt17.73■□□□□ 0.43
PDR12Q02785 CAC2YML102W 1407 nt17.71■□□□□ 0.43
PDR12Q02785 FRD1YEL047C 1413 nt17.66■□□□□ 0.42
PDR12Q02785 RPP2AYOL039W 321 nt17.63■□□□□ 0.41
PDR12Q02785 GFD2YCL036W 1701 nt17.61■□□□□ 0.41
PDR12Q02785 SBA1YKL117W 651 nt17.6■□□□□ 0.41
PDR12Q02785 RTS2YOR077W 699 nt17.56■□□□□ 0.4
PDR12Q02785 DED1YOR204W 1815 nt17.55■□□□□ 0.4
PDR12Q02785 PAU16YKL224C 372 nt17.54■□□□□ 0.4
PDR12Q02785 PTP1YDL230W 1008 nt17.49■□□□□ 0.39
PDR12Q02785 YKL030WYKL030W 606 nt17.48■□□□□ 0.39
PDR12Q02785 YCL042WYCL042W 360 nt17.48■□□□□ 0.39
PDR12Q02785 PET9YBL030C 957 nt17.47■□□□□ 0.39
PDR12Q02785 RRD1YIL153W 1182 nt17.47■□□□□ 0.39
PDR12Q02785 LCB1YMR296C 1677 nt17.45■□□□□ 0.38
PDR12Q02785 YLR235CYLR235C 399 nt17.45■□□□□ 0.38
PDR12Q02785 SOR2YDL246C 1074 nt17.37■□□□□ 0.37
PDR12Q02785 SOR1YJR159W 1074 nt17.37■□□□□ 0.37
PDR12Q02785 PRE6YOL038W 765 nt17.37■□□□□ 0.37
PDR12Q02785 FMT1YBL013W 1206 nt17.32■□□□□ 0.36
PDR12Q02785 FPS1YLL043W 2010 nt17.31■□□□□ 0.36
PDR12Q02785 MEP2YNL142W 1500 nt17.24■□□□□ 0.35
PDR12Q02785 DCW1YKL046C 1350 nt17.2■□□□□ 0.34
PDR12Q02785 YFR018CYFR018C 1092 nt17.17■□□□□ 0.34
PDR12Q02785 CWP1YKL096W 720 nt17.17■□□□□ 0.34
PDR12Q02785 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt17.16■□□□□ 0.34
PDR12Q02785 RRT5YFR032C 870 nt17.15■□□□□ 0.34
PDR12Q02785 TIM23YNR017W 669 nt17.14■□□□□ 0.33
PDR12Q02785 DIC1YLR348C 897 nt17.09■□□□□ 0.33
PDR12Q02785 CUE1YMR264W 612 nt17.05■□□□□ 0.32
PDR12Q02785 ADH2YMR303C 1047 nt17.05■□□□□ 0.32
PDR12Q02785 SNF6YHL025W 999 nt17.04■□□□□ 0.32
PDR12Q02785 YLR179CYLR179C 606 nt17.03■□□□□ 0.32
PDR12Q02785 IRC15YPL017C 1500 nt17■□□□□ 0.31
PDR12Q02785 FMP52YER004W 696 nt16.96■□□□□ 0.31
PDR12Q02785 EMI2YDR516C 1503 nt16.9■□□□□ 0.3
PDR12Q02785 YIL100WYIL100W 354 nt16.87■□□□□ 0.29
PDR12Q02785 YPR064WYPR064W 420 nt16.87■□□□□ 0.29
PDR12Q02785 YFL066CYFL066C 1179 nt16.84■□□□□ 0.29
PDR12Q02785 SPT5YML010W 3192 nt16.82■□□□□ 0.28
PDR12Q02785 YDL221WYDL221W 552 nt16.82■□□□□ 0.28
PDR12Q02785 GIS3YLR094C 1509 nt16.79■□□□□ 0.28
PDR12Q02785 PEX25YPL112C 1185 nt16.78■□□□□ 0.28
PDR12Q02785 WSC2YNL283C 1512 nt16.78■□□□□ 0.28
PDR12Q02785 NAT4YMR069W 858 nt16.77■□□□□ 0.28
PDR12Q02785 TAD3YLR316C 969 nt16.75■□□□□ 0.27
PDR12Q02785 PCM1YEL058W 1674 nt16.69■□□□□ 0.26
PDR12Q02785 GLK1YCL040W 1503 nt16.67■□□□□ 0.26
PDR12Q02785 YNL115CYNL115C 1935 nt16.6■□□□□ 0.25
PDR12Q02785 YIH1YCR059C 777 nt16.6■□□□□ 0.25
PDR12Q02785 AHT1YHR093W 549 nt16.58■□□□□ 0.24
PDR12Q02785 RNQ1YCL028W 1218 nt16.58■□□□□ 0.24
PDR12Q02785 MSF1YPR047W 1410 nt16.55■□□□□ 0.24
PDR12Q02785 YSC84YHR016C 1407 nt16.52■□□□□ 0.24
PDR12Q02785 YMR090WYMR090W 684 nt16.52■□□□□ 0.24
PDR12Q02785 YSP3YOR003W 1437 nt16.49■□□□□ 0.23
PDR12Q02785 SCC4YER147C 1875 nt16.48■□□□□ 0.23
PDR12Q02785 YLL053CYLL053C 459 nt16.48■□□□□ 0.23
PDR12Q02785 MIR1YJR077C 936 nt16.46■□□□□ 0.23
PDR12Q02785 BDH1YAL060W 1149 nt16.46■□□□□ 0.23
PDR12Q02785 YLR415CYLR415C 339 nt16.45■□□□□ 0.22
PDR12Q02785 THI74YDR438W 1113 nt16.43■□□□□ 0.22
PDR12Q02785 SDH1YKL148C 1923 nt16.42■□□□□ 0.22
PDR12Q02785 YMR244WYMR244W 1068 nt16.42■□□□□ 0.22
PDR12Q02785 BIO4YNR057C 714 nt16.4■□□□□ 0.22
PDR12Q02785 FTR1YER145C 1215 nt16.39■□□□□ 0.21
PDR12Q02785 TRM5YHR070W 1500 nt16.34■□□□□ 0.21
PDR12Q02785 GAL1YBR020W 1587 nt16.34■□□□□ 0.21
PDR12Q02785 AQY1YPR192W 918 nt16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms