Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 IMP2'YIL154C 1041 nt20.82■□□□□ 0.92
ATG2P53855 FPR4YLR449W 1179 nt20.81■□□□□ 0.92
ATG2P53855 PHO4YFR034C 939 nt20.74■□□□□ 0.91
ATG2P53855 NAB2YGL122C 1578 nt20.71■□□□□ 0.91
ATG2P53855 ERV46YAL042W 1248 nt20.66■□□□□ 0.9
ATG2P53855 DAL1YIR027C 1383 nt20.66■□□□□ 0.9
ATG2P53855 FUN26YAL022C 1554 nt20.66■□□□□ 0.9
ATG2P53855 TRM9YML014W 840 nt20.63■□□□□ 0.89
ATG2P53855 INM2YDR287W 879 nt20.6■□□□□ 0.89
ATG2P53855 YJL152WYJL152W 360 nt20.56■□□□□ 0.88
ATG2P53855 CCT6YDR188W 1641 nt20.49■□□□□ 0.87
ATG2P53855 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt20.44■□□□□ 0.86
ATG2P53855 YDR094WYDR094W 336 nt20.42■□□□□ 0.86
ATG2P53855 MXR2YCL033C 507 nt20.42■□□□□ 0.86
ATG2P53855 YDR433WYDR433W 441 nt20.41■□□□□ 0.86
ATG2P53855 IDH1YNL037C 1083 nt20.41■□□□□ 0.86
ATG2P53855 SIS1YNL007C 1059 nt20.4■□□□□ 0.86
ATG2P53855 SUF2tP(AGG)C 72 nt20.17■□□□□ 0.82
ATG2P53855 SUF10tP(AGG)N 72 nt20.17■□□□□ 0.82
ATG2P53855 HUA1YGR268C 597 nt20.17■□□□□ 0.82
ATG2P53855 YKR040CYKR040C 504 nt20.17■□□□□ 0.82
ATG2P53855 ALF1YNL148C 765 nt20.17■□□□□ 0.82
ATG2P53855 TIR4YOR009W 1464 nt20.15■□□□□ 0.82
ATG2P53855 GBP2YCL011C 1284 nt20.14■□□□□ 0.81
ATG2P53855 SBA1YKL117W 651 nt20.08■□□□□ 0.81
ATG2P53855 YPS1YLR120C 1710 nt20.06■□□□□ 0.8
ATG2P53855 PTH1YHR189W 573 nt20■□□□□ 0.79
ATG2P53855 YDR095CYDR095C 411 nt19.92■□□□□ 0.78
ATG2P53855 PAU16YKL224C 372 nt19.84■□□□□ 0.77
ATG2P53855 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt19.75■□□□□ 0.75
ATG2P53855 FRD1YEL047C 1413 nt19.74■□□□□ 0.75
ATG2P53855 TCD2YKL027W 1344 nt19.72■□□□□ 0.75
ATG2P53855 PRE6YOL038W 765 nt19.63■□□□□ 0.73
ATG2P53855 CAC2YML102W 1407 nt19.61■□□□□ 0.73
ATG2P53855 YMR057CYMR057C 372 nt19.6■□□□□ 0.73
ATG2P53855 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt19.59■□□□□ 0.73
ATG2P53855 DED1YOR204W 1815 nt19.57■□□□□ 0.72
ATG2P53855 ART5YGR068C 1761 nt19.57■□□□□ 0.72
ATG2P53855 LCB1YMR296C 1677 nt19.52■□□□□ 0.71
ATG2P53855 YKL030WYKL030W 606 nt19.51■□□□□ 0.71
ATG2P53855 GFD2YCL036W 1701 nt19.49■□□□□ 0.71
ATG2P53855 YLR235CYLR235C 399 nt19.46■□□□□ 0.71
ATG2P53855 RRD1YIL153W 1182 nt19.44■□□□□ 0.7
ATG2P53855 SOR2YDL246C 1074 nt19.43■□□□□ 0.7
ATG2P53855 SOR1YJR159W 1074 nt19.43■□□□□ 0.7
ATG2P53855 RPP2AYOL039W 321 nt19.4■□□□□ 0.7
ATG2P53855 RTS2YOR077W 699 nt19.38■□□□□ 0.69
ATG2P53855 YCL042WYCL042W 360 nt19.38■□□□□ 0.69
ATG2P53855 YFR018CYFR018C 1092 nt19.37■□□□□ 0.69
ATG2P53855 PTP1YDL230W 1008 nt19.32■□□□□ 0.68
ATG2P53855 FMT1YBL013W 1206 nt19.31■□□□□ 0.68
ATG2P53855 PET9YBL030C 957 nt19.27■□□□□ 0.67
ATG2P53855 RRT5YFR032C 870 nt19.21■□□□□ 0.67
ATG2P53855 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt19.21■□□□□ 0.67
ATG2P53855 SNF6YHL025W 999 nt19.19■□□□□ 0.66
ATG2P53855 FPS1YLL043W 2010 nt19.18■□□□□ 0.66
ATG2P53855 TIM23YNR017W 669 nt19.12■□□□□ 0.65
ATG2P53855 DIC1YLR348C 897 nt19.11■□□□□ 0.65
ATG2P53855 CWP1YKL096W 720 nt19.01■□□□□ 0.63
ATG2P53855 YLR179CYLR179C 606 nt18.95■□□□□ 0.62
ATG2P53855 ADH2YMR303C 1047 nt18.9■□□□□ 0.62
ATG2P53855 DCW1YKL046C 1350 nt18.89■□□□□ 0.62
ATG2P53855 MEP2YNL142W 1500 nt18.88■□□□□ 0.61
ATG2P53855 YFL066CYFL066C 1179 nt18.87■□□□□ 0.61
ATG2P53855 PEX25YPL112C 1185 nt18.83■□□□□ 0.6
ATG2P53855 CUE1YMR264W 612 nt18.81■□□□□ 0.6
ATG2P53855 FMP52YER004W 696 nt18.8■□□□□ 0.6
ATG2P53855 NAT4YMR069W 858 nt18.79■□□□□ 0.6
ATG2P53855 YPR064WYPR064W 420 nt18.78■□□□□ 0.6
ATG2P53855 WSC2YNL283C 1512 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG2P53855 IRC15YPL017C 1500 nt18.75■□□□□ 0.59
ATG2P53855 TAD3YLR316C 969 nt18.68■□□□□ 0.58
ATG2P53855 GLK1YCL040W 1503 nt18.64■□□□□ 0.57
ATG2P53855 MSF1YPR047W 1410 nt18.6■□□□□ 0.57
ATG2P53855 YMR244WYMR244W 1068 nt18.58■□□□□ 0.56
ATG2P53855 YNL115CYNL115C 1935 nt18.55■□□□□ 0.56
ATG2P53855 EMI2YDR516C 1503 nt18.53■□□□□ 0.56
ATG2P53855 MIR1YJR077C 936 nt18.52■□□□□ 0.56
ATG2P53855 YIL100WYIL100W 354 nt18.51■□□□□ 0.55
ATG2P53855 AHT1YHR093W 549 nt18.49■□□□□ 0.55
ATG2P53855 YSP3YOR003W 1437 nt18.47■□□□□ 0.55
ATG2P53855 YIH1YCR059C 777 nt18.44■□□□□ 0.54
ATG2P53855 YDL221WYDL221W 552 nt18.44■□□□□ 0.54
ATG2P53855 PCM1YEL058W 1674 nt18.44■□□□□ 0.54
ATG2P53855 GIS3YLR094C 1509 nt18.44■□□□□ 0.54
ATG2P53855 THI74YDR438W 1113 nt18.4■□□□□ 0.54
ATG2P53855 BDH1YAL060W 1149 nt18.4■□□□□ 0.54
ATG2P53855 RNQ1YCL028W 1218 nt18.36■□□□□ 0.53
ATG2P53855 GLR1YPL091W 1452 nt18.35■□□□□ 0.53
ATG2P53855 YSC84YHR016C 1407 nt18.35■□□□□ 0.53
ATG2P53855 SPT5YML010W 3192 nt18.32■□□□□ 0.52
ATG2P53855 YLR415CYLR415C 339 nt18.3■□□□□ 0.52
ATG2P53855 RBG2YGR173W 1107 nt18.28■□□□□ 0.52
ATG2P53855 YLL053CYLL053C 459 nt18.26■□□□□ 0.51
ATG2P53855 FTR1YER145C 1215 nt18.2■□□□□ 0.5
ATG2P53855 BIO4YNR057C 714 nt18.17■□□□□ 0.5
ATG2P53855 VPS75YNL246W 795 nt18.15■□□□□ 0.5
ATG2P53855 DAT1YML113W 747 nt18.14■□□□□ 0.49
ATG2P53855 TRM5YHR070W 1500 nt18.11■□□□□ 0.49
ATG2P53855 AQY1YPR192W 918 nt18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.7 ms