Protein–RNA interactions for Protein: P47080

YJL007C, Uncharacterized protein YJL007C, yeastyeast

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL007CP47080 YCH1YGR203W 447 nt14.05□□□□□ -0.16
YJL007CP47080 IMP2'YIL154C 1041 nt14.04□□□□□ -0.16
YJL007CP47080 MRPL8YJL063C 717 nt13.96□□□□□ -0.17
YJL007CP47080 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.88□□□□□ -0.19
YJL007CP47080 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.88□□□□□ -0.19
YJL007CP47080 YJL152WYJL152W 360 nt13.86□□□□□ -0.19
YJL007CP47080 ALF1YNL148C 765 nt13.86□□□□□ -0.19
YJL007CP47080 LPX1YOR084W 1164 nt13.86□□□□□ -0.19
YJL007CP47080 YGR139WYGR139W 339 nt13.85□□□□□ -0.19
YJL007CP47080 SPP1YPL138C 1062 nt13.82□□□□□ -0.2
YJL007CP47080 ERV46YAL042W 1248 nt13.79□□□□□ -0.2
YJL007CP47080 YPS1YLR120C 1710 nt13.74□□□□□ -0.21
YJL007CP47080 ADO1YJR105W 1023 nt13.74□□□□□ -0.21
YJL007CP47080 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.73□□□□□ -0.21
YJL007CP47080 YEL076CYEL076C 651 nt13.73□□□□□ -0.21
YJL007CP47080 YLR464WYLR464W 651 nt13.73□□□□□ -0.21
YJL007CP47080 IDH1YNL037C 1083 nt13.73□□□□□ -0.21
YJL007CP47080 YDR095CYDR095C 411 nt13.71□□□□□ -0.21
YJL007CP47080 RTG1YOL067C 534 nt13.7□□□□□ -0.22
YJL007CP47080 YDR433WYDR433W 441 nt13.69□□□□□ -0.22
YJL007CP47080 UBX6YJL048C 1191 nt13.69□□□□□ -0.22
YJL007CP47080 SIS1YNL007C 1059 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL007CP47080 YKR040CYKR040C 504 nt13.66□□□□□ -0.22
YJL007CP47080 TIR4YOR009W 1464 nt13.62□□□□□ -0.23
YJL007CP47080 GBP2YCL011C 1284 nt13.58□□□□□ -0.24
YJL007CP47080 MXR2YCL033C 507 nt13.58□□□□□ -0.24
YJL007CP47080 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.55□□□□□ -0.24
YJL007CP47080 RPP2AYOL039W 321 nt13.47□□□□□ -0.25
YJL007CP47080 CAC2YML102W 1407 nt13.46□□□□□ -0.26
YJL007CP47080 ART5YGR068C 1761 nt13.45□□□□□ -0.26
YJL007CP47080 YMR057CYMR057C 372 nt13.45□□□□□ -0.26
YJL007CP47080 PTP1YDL230W 1008 nt13.41□□□□□ -0.26
YJL007CP47080 HUA1YGR268C 597 nt13.39□□□□□ -0.27
YJL007CP47080 PET9YBL030C 957 nt13.39□□□□□ -0.27
YJL007CP47080 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.37□□□□□ -0.27
YJL007CP47080 TCD2YKL027W 1344 nt13.35□□□□□ -0.27
YJL007CP47080 YDR094WYDR094W 336 nt13.33□□□□□ -0.28
YJL007CP47080 GFD2YCL036W 1701 nt13.33□□□□□ -0.28
YJL007CP47080 MEP2YNL142W 1500 nt13.29□□□□□ -0.28
YJL007CP47080 DED1YOR204W 1815 nt13.28□□□□□ -0.28
YJL007CP47080 FRD1YEL047C 1413 nt13.28□□□□□ -0.28
YJL007CP47080 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.23□□□□□ -0.29
YJL007CP47080 SPT5YML010W 3192 nt13.22□□□□□ -0.29
YJL007CP47080 RRD1YIL153W 1182 nt13.22□□□□□ -0.29
YJL007CP47080 PTH1YHR189W 573 nt13.18□□□□□ -0.3
YJL007CP47080 FPS1YLL043W 2010 nt13.18□□□□□ -0.3
YJL007CP47080 DCW1YKL046C 1350 nt13.13□□□□□ -0.31
YJL007CP47080 FMT1YBL013W 1206 nt13.13□□□□□ -0.31
YJL007CP47080 YKL030WYKL030W 606 nt13.12□□□□□ -0.31
YJL007CP47080 RTS2YOR077W 699 nt13.1□□□□□ -0.31
YJL007CP47080 YCL042WYCL042W 360 nt13.1□□□□□ -0.31
YJL007CP47080 YLR235CYLR235C 399 nt13.07□□□□□ -0.32
YJL007CP47080 SOR2YDL246C 1074 nt13.05□□□□□ -0.32
YJL007CP47080 SOR1YJR159W 1074 nt13.05□□□□□ -0.32
YJL007CP47080 LCB1YMR296C 1677 nt13.04□□□□□ -0.32
YJL007CP47080 IRC15YPL017C 1500 nt13□□□□□ -0.33
YJL007CP47080 CSM2YIL132C 642 nt12.98□□□□□ -0.33
YJL007CP47080 CUE1YMR264W 612 nt12.96□□□□□ -0.33
YJL007CP47080 EMI2YDR516C 1503 nt12.96□□□□□ -0.33
YJL007CP47080 CWP1YKL096W 720 nt12.91□□□□□ -0.34
YJL007CP47080 YDL221WYDL221W 552 nt12.9□□□□□ -0.34
YJL007CP47080 GIS3YLR094C 1509 nt12.89□□□□□ -0.35
YJL007CP47080 FMP52YER004W 696 nt12.88□□□□□ -0.35
YJL007CP47080 ADH2YMR303C 1047 nt12.88□□□□□ -0.35
YJL007CP47080 SBA1YKL117W 651 nt12.87□□□□□ -0.35
YJL007CP47080 PAU16YKL224C 372 nt12.87□□□□□ -0.35
YJL007CP47080 YFR018CYFR018C 1092 nt12.83□□□□□ -0.36
YJL007CP47080 TIM23YNR017W 669 nt12.82□□□□□ -0.36
YJL007CP47080 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.8□□□□□ -0.36
YJL007CP47080 PRE6YOL038W 765 nt12.79□□□□□ -0.36
YJL007CP47080 YIL100WYIL100W 354 nt12.78□□□□□ -0.36
YJL007CP47080 DIC1YLR348C 897 nt12.77□□□□□ -0.37
YJL007CP47080 YMR090WYMR090W 684 nt12.77□□□□□ -0.37
YJL007CP47080 RRT5YFR032C 870 nt12.76□□□□□ -0.37
YJL007CP47080 YLR179CYLR179C 606 nt12.73□□□□□ -0.37
YJL007CP47080 PCM1YEL058W 1674 nt12.71□□□□□ -0.37
YJL007CP47080 SNF6YHL025W 999 nt12.69□□□□□ -0.38
YJL007CP47080 YPR064WYPR064W 420 nt12.68□□□□□ -0.38
YJL007CP47080 SCC4YER147C 1875 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL007CP47080 SDH1YKL148C 1923 nt12.64□□□□□ -0.39
YJL007CP47080 TAD3YLR316C 969 nt12.64□□□□□ -0.39
YJL007CP47080 MET8YBR213W 825 nt12.64□□□□□ -0.39
YJL007CP47080 RNQ1YCL028W 1218 nt12.64□□□□□ -0.39
YJL007CP47080 WSC2YNL283C 1512 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL007CP47080 YIH1YCR059C 777 nt12.6□□□□□ -0.39
YJL007CP47080 YFL066CYFL066C 1179 nt12.6□□□□□ -0.39
YJL007CP47080 AHT1YHR093W 549 nt12.6□□□□□ -0.39
YJL007CP47080 PAU21YOR394W 495 nt12.57□□□□□ -0.4
YJL007CP47080 PAU22YPL282C 495 nt12.57□□□□□ -0.4
YJL007CP47080 YBR220CYBR220C 1683 nt12.54□□□□□ -0.4
YJL007CP47080 CLB6YGR109C 1143 nt12.51□□□□□ -0.41
YJL007CP47080 PEX25YPL112C 1185 nt12.48□□□□□ -0.41
YJL007CP47080 YLL053CYLL053C 459 nt12.47□□□□□ -0.41
YJL007CP47080 BDH1YAL060W 1149 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL007CP47080 SSA4YER103W 1929 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL007CP47080 YSP3YOR003W 1437 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL007CP47080 NAT4YMR069W 858 nt12.43□□□□□ -0.42
YJL007CP47080 YNL195CYNL195C 786 nt12.43□□□□□ -0.42
YJL007CP47080 YSC84YHR016C 1407 nt12.43□□□□□ -0.42
YJL007CP47080 RRT12YCR045C 1476 nt12.41□□□□□ -0.42
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