Protein–RNA interactions for Protein: P40347

LTP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LTP1P40347 CCT6YDR188W 1641 nt11.93□□□□□ -0.5
LTP1P40347 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.92□□□□□ -0.5
LTP1P40347 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.77□□□□□ -0.53
LTP1P40347 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.77□□□□□ -0.53
LTP1P40347 ADO1YJR105W 1023 nt11.77□□□□□ -0.53
LTP1P40347 ERV46YAL042W 1248 nt11.74□□□□□ -0.53
LTP1P40347 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.72□□□□□ -0.53
LTP1P40347 YEL076CYEL076C 651 nt11.72□□□□□ -0.53
LTP1P40347 YLR464WYLR464W 651 nt11.72□□□□□ -0.53
LTP1P40347 LPX1YOR084W 1164 nt11.72□□□□□ -0.53
LTP1P40347 ALF1YNL148C 765 nt11.69□□□□□ -0.54
LTP1P40347 RTG1YOL067C 534 nt11.66□□□□□ -0.54
LTP1P40347 IDH1YNL037C 1083 nt11.65□□□□□ -0.54
LTP1P40347 SPP1YPL138C 1062 nt11.65□□□□□ -0.54
LTP1P40347 YJL152WYJL152W 360 nt11.64□□□□□ -0.55
LTP1P40347 UBX6YJL048C 1191 nt11.63□□□□□ -0.55
LTP1P40347 YDR095CYDR095C 411 nt11.6□□□□□ -0.55
LTP1P40347 SIS1YNL007C 1059 nt11.6□□□□□ -0.55
LTP1P40347 YPS1YLR120C 1710 nt11.6□□□□□ -0.55
LTP1P40347 YKR040CYKR040C 504 nt11.58□□□□□ -0.56
LTP1P40347 YDR433WYDR433W 441 nt11.55□□□□□ -0.56
LTP1P40347 TIR4YOR009W 1464 nt11.5□□□□□ -0.57
LTP1P40347 GBP2YCL011C 1284 nt11.47□□□□□ -0.57
LTP1P40347 MXR2YCL033C 507 nt11.42□□□□□ -0.58
LTP1P40347 HUA1YGR268C 597 nt11.41□□□□□ -0.58
LTP1P40347 YDR094WYDR094W 336 nt11.4□□□□□ -0.58
LTP1P40347 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.39□□□□□ -0.59
LTP1P40347 CAC2YML102W 1407 nt11.38□□□□□ -0.59
LTP1P40347 RPP2AYOL039W 321 nt11.37□□□□□ -0.59
LTP1P40347 PET9YBL030C 957 nt11.32□□□□□ -0.6
LTP1P40347 ART5YGR068C 1761 nt11.31□□□□□ -0.6
LTP1P40347 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.3□□□□□ -0.6
LTP1P40347 TCD2YKL027W 1344 nt11.3□□□□□ -0.6
LTP1P40347 PTP1YDL230W 1008 nt11.29□□□□□ -0.6
LTP1P40347 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.29□□□□□ -0.6
LTP1P40347 YMR057CYMR057C 372 nt11.28□□□□□ -0.6
LTP1P40347 FRD1YEL047C 1413 nt11.25□□□□□ -0.61
LTP1P40347 GFD2YCL036W 1701 nt11.23□□□□□ -0.61
LTP1P40347 DED1YOR204W 1815 nt11.22□□□□□ -0.61
LTP1P40347 MEP2YNL142W 1500 nt11.18□□□□□ -0.62
LTP1P40347 RRD1YIL153W 1182 nt11.17□□□□□ -0.62
LTP1P40347 YKL030WYKL030W 606 nt11.14□□□□□ -0.63
LTP1P40347 SPT5YML010W 3192 nt11.13□□□□□ -0.63
LTP1P40347 YLR235CYLR235C 399 nt11.12□□□□□ -0.63
LTP1P40347 FPS1YLL043W 2010 nt11.12□□□□□ -0.63
LTP1P40347 SOR2YDL246C 1074 nt11.11□□□□□ -0.63
LTP1P40347 PTH1YHR189W 573 nt11.11□□□□□ -0.63
LTP1P40347 SOR1YJR159W 1074 nt11.11□□□□□ -0.63
LTP1P40347 YCL042WYCL042W 360 nt11.08□□□□□ -0.64
LTP1P40347 FMT1YBL013W 1206 nt11.06□□□□□ -0.64
LTP1P40347 LCB1YMR296C 1677 nt11.03□□□□□ -0.64
LTP1P40347 RTS2YOR077W 699 nt10.99□□□□□ -0.65
LTP1P40347 DCW1YKL046C 1350 nt10.99□□□□□ -0.65
LTP1P40347 FMP52YER004W 696 nt10.96□□□□□ -0.65
LTP1P40347 YFR018CYFR018C 1092 nt10.95□□□□□ -0.66
LTP1P40347 CUE1YMR264W 612 nt10.95□□□□□ -0.66
LTP1P40347 SBA1YKL117W 651 nt10.94□□□□□ -0.66
LTP1P40347 PAU16YKL224C 372 nt10.94□□□□□ -0.66
LTP1P40347 IRC15YPL017C 1500 nt10.93□□□□□ -0.66
LTP1P40347 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.9□□□□□ -0.66
LTP1P40347 EMI2YDR516C 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
LTP1P40347 YDL221WYDL221W 552 nt10.87□□□□□ -0.67
LTP1P40347 RRT5YFR032C 870 nt10.87□□□□□ -0.67
LTP1P40347 CWP1YKL096W 720 nt10.86□□□□□ -0.67
LTP1P40347 TIM23YNR017W 669 nt10.86□□□□□ -0.67
LTP1P40347 ADH2YMR303C 1047 nt10.84□□□□□ -0.67
LTP1P40347 PRE6YOL038W 765 nt10.83□□□□□ -0.68
LTP1P40347 GIS3YLR094C 1509 nt10.82□□□□□ -0.68
LTP1P40347 DIC1YLR348C 897 nt10.81□□□□□ -0.68
LTP1P40347 YIL100WYIL100W 354 nt10.77□□□□□ -0.69
LTP1P40347 YMR090WYMR090W 684 nt10.76□□□□□ -0.69
LTP1P40347 YPR064WYPR064W 420 nt10.76□□□□□ -0.69
LTP1P40347 YLR179CYLR179C 606 nt10.75□□□□□ -0.69
LTP1P40347 TAD3YLR316C 969 nt10.72□□□□□ -0.69
LTP1P40347 PCM1YEL058W 1674 nt10.72□□□□□ -0.69
LTP1P40347 SNF6YHL025W 999 nt10.71□□□□□ -0.69
LTP1P40347 WSC2YNL283C 1512 nt10.7□□□□□ -0.7
LTP1P40347 AHT1YHR093W 549 nt10.7□□□□□ -0.7
LTP1P40347 RNQ1YCL028W 1218 nt10.7□□□□□ -0.7
LTP1P40347 YIH1YCR059C 777 nt10.68□□□□□ -0.7
LTP1P40347 SCC4YER147C 1875 nt10.65□□□□□ -0.7
LTP1P40347 SDH1YKL148C 1923 nt10.64□□□□□ -0.71
LTP1P40347 PEX25YPL112C 1185 nt10.63□□□□□ -0.71
LTP1P40347 YFL066CYFL066C 1179 nt10.61□□□□□ -0.71
LTP1P40347 NAT4YMR069W 858 nt10.57□□□□□ -0.72
LTP1P40347 AQY1YPR192W 918 nt10.56□□□□□ -0.72
LTP1P40347 YSP3YOR003W 1437 nt10.56□□□□□ -0.72
LTP1P40347 BDH1YAL060W 1149 nt10.54□□□□□ -0.72
LTP1P40347 YBR220CYBR220C 1683 nt10.53□□□□□ -0.72
LTP1P40347 YLL053CYLL053C 459 nt10.51□□□□□ -0.73
LTP1P40347 YNL115CYNL115C 1935 nt10.5□□□□□ -0.73
LTP1P40347 YSC84YHR016C 1407 nt10.5□□□□□ -0.73
LTP1P40347 FTR1YER145C 1215 nt10.49□□□□□ -0.73
LTP1P40347 GLK1YCL040W 1503 nt10.48□□□□□ -0.73
LTP1P40347 MSF1YPR047W 1410 nt10.47□□□□□ -0.73
LTP1P40347 YLR415CYLR415C 339 nt10.46□□□□□ -0.73
LTP1P40347 YNL195CYNL195C 786 nt10.46□□□□□ -0.73
LTP1P40347 BIO4YNR057C 714 nt10.46□□□□□ -0.73
LTP1P40347 GAL1YBR020W 1587 nt10.46□□□□□ -0.74
LTP1P40347 MIR1YJR077C 936 nt10.43□□□□□ -0.74
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