Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Hoxa2P31245 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Hoxa2P31245 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Hoxa2P31245 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hoxa2P31245 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Hoxa2P31245 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxa2P31245 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxa2P31245 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxa2P31245 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Hoxa2P31245 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Hoxa2P31245 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Hoxa2P31245 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Hoxa2P31245 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Hoxa2P31245 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Hoxa2P31245 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Hoxa2P31245 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Hoxa2P31245 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Hoxa2P31245 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Hoxa2P31245 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Hoxa2P31245 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Hoxa2P31245 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Hoxa2P31245 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Hoxa2P31245 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Hoxa2P31245 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Hoxa2P31245 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Hoxa2P31245 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Hoxa2P31245 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Hoxa2P31245 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Hoxa2P31245 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Hoxa2P31245 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Hoxa2P31245 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Hoxa2P31245 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Hoxa2P31245 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Hoxa2P31245 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Hoxa2P31245 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Hoxa2P31245 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Hoxa2P31245 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxa2P31245 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Hoxa2P31245 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Hoxa2P31245 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Hoxa2P31245 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Hoxa2P31245 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Hoxa2P31245 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Hoxa2P31245 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Hoxa2P31245 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Hoxa2P31245 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Hoxa2P31245 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,2■■□□□ 1,79
Hoxa2P31245 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Hoxa2P31245 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hoxa2P31245 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hoxa2P31245 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxa2P31245 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxa2P31245 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxa2P31245 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxa2P31245 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Hoxa2P31245 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Hoxa2P31245 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Hoxa2P31245 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Hoxa2P31245 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Hoxa2P31245 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Hoxa2P31245 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxa2P31245 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Hoxa2P31245 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Hoxa2P31245 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Hoxa2P31245 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Hoxa2P31245 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Hoxa2P31245 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Hoxa2P31245 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Hoxa2P31245 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Hoxa2P31245 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Hoxa2P31245 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Hoxa2P31245 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Hoxa2P31245 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Hoxa2P31245 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Hoxa2P31245 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Hoxa2P31245 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Hoxa2P31245 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Hoxa2P31245 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Hoxa2P31245 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Hoxa2P31245 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Hoxa2P31245 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Hoxa2P31245 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Hoxa2P31245 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms