Protein–RNA interactions for Protein: P0CX15

YRF1-7, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-7P0CX15 INM2YDR287W 879 nt15.99■□□□□ 0.15
YRF1-7P0CX15 UBX6YJL048C 1191 nt15.97■□□□□ 0.15
YRF1-7P0CX15 DAL1YIR027C 1383 nt15.94■□□□□ 0.14
YRF1-7P0CX15 FUN26YAL022C 1554 nt15.9■□□□□ 0.14
YRF1-7P0CX15 ERV46YAL042W 1248 nt15.87■□□□□ 0.13
YRF1-7P0CX15 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.86■□□□□ 0.13
YRF1-7P0CX15 YEL076CYEL076C 651 nt15.86■□□□□ 0.13
YRF1-7P0CX15 YLR464WYLR464W 651 nt15.86■□□□□ 0.13
YRF1-7P0CX15 ADO1YJR105W 1023 nt15.85■□□□□ 0.13
YRF1-7P0CX15 YJL152WYJL152W 360 nt15.84■□□□□ 0.13
YRF1-7P0CX15 CCT6YDR188W 1641 nt15.81■□□□□ 0.12
YRF1-7P0CX15 MXR2YCL033C 507 nt15.69■□□□□ 0.1
YRF1-7P0CX15 SIS1YNL007C 1059 nt15.69■□□□□ 0.1
YRF1-7P0CX15 IDH1YNL037C 1083 nt15.63■□□□□ 0.09
YRF1-7P0CX15 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.61■□□□□ 0.09
YRF1-7P0CX15 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.61■□□□□ 0.09
YRF1-7P0CX15 ALF1YNL148C 765 nt15.6■□□□□ 0.09
YRF1-7P0CX15 YDR094WYDR094W 336 nt15.56■□□□□ 0.08
YRF1-7P0CX15 YDR433WYDR433W 441 nt15.55■□□□□ 0.08
YRF1-7P0CX15 TIR4YOR009W 1464 nt15.53■□□□□ 0.08
YRF1-7P0CX15 GBP2YCL011C 1284 nt15.52■□□□□ 0.07
YRF1-7P0CX15 YDR095CYDR095C 411 nt15.51■□□□□ 0.07
YRF1-7P0CX15 YKR040CYKR040C 504 nt15.5■□□□□ 0.07
YRF1-7P0CX15 YPS1YLR120C 1710 nt15.48■□□□□ 0.07
YRF1-7P0CX15 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.44■□□□□ 0.06
YRF1-7P0CX15 PTH1YHR189W 573 nt15.35■□□□□ 0.05
YRF1-7P0CX15 HUA1YGR268C 597 nt15.31■□□□□ 0.04
YRF1-7P0CX15 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.22■□□□□ 0.03
YRF1-7P0CX15 CAC2YML102W 1407 nt15.22■□□□□ 0.03
YRF1-7P0CX15 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.2■□□□□ 0.02
YRF1-7P0CX15 ART5YGR068C 1761 nt15.2■□□□□ 0.02
YRF1-7P0CX15 TCD2YKL027W 1344 nt15.19■□□□□ 0.02
YRF1-7P0CX15 YMR057CYMR057C 372 nt15.18■□□□□ 0.02
YRF1-7P0CX15 FRD1YEL047C 1413 nt15.17■□□□□ 0.02
YRF1-7P0CX15 GFD2YCL036W 1701 nt15.15■□□□□ 0.02
YRF1-7P0CX15 DED1YOR204W 1815 nt15.1■□□□□ 0.01
YRF1-7P0CX15 PTP1YDL230W 1008 nt15.09■□□□□ 0.01
YRF1-7P0CX15 SBA1YKL117W 651 nt15.09■□□□□ 0.01
YRF1-7P0CX15 RPP2AYOL039W 321 nt15.08■□□□□ 0.01
YRF1-7P0CX15 PAU16YKL224C 372 nt15.08■□□□□ 0
YRF1-7P0CX15 PRE6YOL038W 765 nt15.01□□□□□ -0.01
YRF1-7P0CX15 RRD1YIL153W 1182 nt15□□□□□ -0.01
YRF1-7P0CX15 SOR2YDL246C 1074 nt14.99□□□□□ -0.01
YRF1-7P0CX15 SOR1YJR159W 1074 nt14.99□□□□□ -0.01
YRF1-7P0CX15 PET9YBL030C 957 nt14.97□□□□□ -0.01
YRF1-7P0CX15 RTS2YOR077W 699 nt14.97□□□□□ -0.01
YRF1-7P0CX15 FMT1YBL013W 1206 nt14.95□□□□□ -0.02
YRF1-7P0CX15 LCB1YMR296C 1677 nt14.94□□□□□ -0.02
YRF1-7P0CX15 YLR235CYLR235C 399 nt14.93□□□□□ -0.02
YRF1-7P0CX15 YKL030WYKL030W 606 nt14.91□□□□□ -0.02
YRF1-7P0CX15 YCL042WYCL042W 360 nt14.91□□□□□ -0.02
YRF1-7P0CX15 YFR018CYFR018C 1092 nt14.87□□□□□ -0.03
YRF1-7P0CX15 FPS1YLL043W 2010 nt14.84□□□□□ -0.03
YRF1-7P0CX15 DCW1YKL046C 1350 nt14.82□□□□□ -0.04
YRF1-7P0CX15 MEP2YNL142W 1500 nt14.78□□□□□ -0.04
YRF1-7P0CX15 TIM23YNR017W 669 nt14.75□□□□□ -0.05
YRF1-7P0CX15 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.67□□□□□ -0.06
YRF1-7P0CX15 CUE1YMR264W 612 nt14.66□□□□□ -0.06
YRF1-7P0CX15 IRC15YPL017C 1500 nt14.65□□□□□ -0.06
YRF1-7P0CX15 CWP1YKL096W 720 nt14.64□□□□□ -0.07
YRF1-7P0CX15 YLR179CYLR179C 606 nt14.59□□□□□ -0.07
YRF1-7P0CX15 RRT5YFR032C 870 nt14.59□□□□□ -0.07
YRF1-7P0CX15 ADH2YMR303C 1047 nt14.59□□□□□ -0.07
YRF1-7P0CX15 DIC1YLR348C 897 nt14.56□□□□□ -0.08
YRF1-7P0CX15 EMI2YDR516C 1503 nt14.55□□□□□ -0.08
YRF1-7P0CX15 FMP52YER004W 696 nt14.55□□□□□ -0.08
YRF1-7P0CX15 SNF6YHL025W 999 nt14.54□□□□□ -0.08
YRF1-7P0CX15 YFL066CYFL066C 1179 nt14.5□□□□□ -0.09
YRF1-7P0CX15 YPR064WYPR064W 420 nt14.48□□□□□ -0.09
YRF1-7P0CX15 SPT5YML010W 3192 nt14.47□□□□□ -0.09
YRF1-7P0CX15 WSC2YNL283C 1512 nt14.4□□□□□ -0.1
YRF1-7P0CX15 PEX25YPL112C 1185 nt14.36□□□□□ -0.11
YRF1-7P0CX15 YDL221WYDL221W 552 nt14.34□□□□□ -0.11
YRF1-7P0CX15 TAD3YLR316C 969 nt14.34□□□□□ -0.11
YRF1-7P0CX15 GIS3YLR094C 1509 nt14.33□□□□□ -0.12
YRF1-7P0CX15 YIL100WYIL100W 354 nt14.33□□□□□ -0.12
YRF1-7P0CX15 YIH1YCR059C 777 nt14.32□□□□□ -0.12
YRF1-7P0CX15 PCM1YEL058W 1674 nt14.25□□□□□ -0.13
YRF1-7P0CX15 YLL053CYLL053C 459 nt14.21□□□□□ -0.14
YRF1-7P0CX15 YSP3YOR003W 1437 nt14.2□□□□□ -0.14
YRF1-7P0CX15 NAT4YMR069W 858 nt14.2□□□□□ -0.14
YRF1-7P0CX15 AHT1YHR093W 549 nt14.19□□□□□ -0.14
YRF1-7P0CX15 YSC84YHR016C 1407 nt14.19□□□□□ -0.14
YRF1-7P0CX15 YNL115CYNL115C 1935 nt14.19□□□□□ -0.14
YRF1-7P0CX15 GLK1YCL040W 1503 nt14.18□□□□□ -0.14
YRF1-7P0CX15 MIR1YJR077C 936 nt14.15□□□□□ -0.14
YRF1-7P0CX15 FTR1YER145C 1215 nt14.14□□□□□ -0.15
YRF1-7P0CX15 MSF1YPR047W 1410 nt14.14□□□□□ -0.15
YRF1-7P0CX15 SDH1YKL148C 1923 nt14.14□□□□□ -0.15
YRF1-7P0CX15 RNQ1YCL028W 1218 nt14.12□□□□□ -0.15
YRF1-7P0CX15 SCC4YER147C 1875 nt14.12□□□□□ -0.15
YRF1-7P0CX15 BDH1YAL060W 1149 nt14.11□□□□□ -0.15
YRF1-7P0CX15 BIO4YNR057C 714 nt14.08□□□□□ -0.16
YRF1-7P0CX15 YLR415CYLR415C 339 nt14.07□□□□□ -0.16
YRF1-7P0CX15 YMR090WYMR090W 684 nt14.06□□□□□ -0.16
YRF1-7P0CX15 YMR244WYMR244W 1068 nt14.06□□□□□ -0.16
YRF1-7P0CX15 ATF2YGR177C 1608 nt14.02□□□□□ -0.17
YRF1-7P0CX15 RRT12YCR045C 1476 nt14.01□□□□□ -0.17
YRF1-7P0CX15 TRM5YHR070W 1500 nt14□□□□□ -0.17
YRF1-7P0CX15 GAL1YBR020W 1587 nt13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms