Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 LMF2-205ENST00000507607 605 ntTSL 217.96■□□□□ 0.473e-16■■■■■ 53.3
PRPF4O43172 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-12■■■■■ 52.7
PRPF4O43172 ITIH2-206ENST00000480387 573 ntTSL 38.56□□□□□ -1.042e-9■■■■■ 52.6
PRPF4O43172 ITIH2-203ENST00000429820 767 ntTSL 38.14□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 52.6
PRPF4O43172 KIAA0355-206ENST00000589583 582 ntTSL 313.68□□□□□ -0.228e-14■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 KIAA0355-204ENST00000588470 632 ntTSL 513.6□□□□□ -0.238e-14■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.678e-14■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 KIAA0355-203ENST00000588338 561 ntTSL 59.61□□□□□ -0.878e-14■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 ARHGAP4-224ENST00000494813 1939 ntTSL 522.46■■□□□ 1.191e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-211ENST00000477750 1062 ntTSL 219.31■□□□□ 0.681e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-206ENST00000432089 599 ntTSL 318.35■□□□□ 0.531e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-210ENST00000467451 743 ntTSL 217.69■□□□□ 0.421e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-207ENST00000460996 908 ntTSL 217.04■□□□□ 0.321e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-209ENST00000466877 1080 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.291e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-215ENST00000484950 873 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-15■■■■■ 51.6
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PRPF4O43172 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-204ENST00000393710 525 ntTSL 214.43□□□□□ -0.11e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-212ENST00000477882 809 ntTSL 214.19□□□□□ -0.141e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-15■■■■■ 51.6
PRPF4O43172 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.178e-22■■■■■ 51.4
PRPF4O43172 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 51
PRPF4O43172 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 51
PRPF4O43172 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 51
PRPF4O43172 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 05e-7■■■■■ 51
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PRPF4O43172 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-15■■■■■ 49.8
PRPF4O43172 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.859e-15■■■■■ 49.5
PRPF4O43172 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.069e-15■■■■■ 49.5
PRPF4O43172 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.139e-15■■■■■ 49.5
PRPF4O43172 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.331e-8■■■■■ 49.3
PRPF4O43172 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 49.3
PRPF4O43172 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 49.3
PRPF4O43172 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 49.3
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PRPF4O43172 UGP2-227ENST00000497510 722 ntTSL 419.3■□□□□ 0.682e-20■■■■■ 46.8
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PRPF4O43172 UGP2-219ENST00000487469 1015 ntTSL 517.61■□□□□ 0.412e-20■■■■■ 46.8
PRPF4O43172 UGP2-215ENST00000483461 495 ntTSL 417.27■□□□□ 0.362e-20■■■■■ 46.8
PRPF4O43172 UGP2-205ENST00000466642 1023 ntTSL 417.03■□□□□ 0.322e-20■■■■■ 46.8
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PRPF4O43172 UGP2-214ENST00000483108 598 ntTSL 416.08■□□□□ 0.162e-20■■■■■ 46.8
PRPF4O43172 UGP2-206ENST00000467400 717 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-20■■■■■ 46.8
PRPF4O43172 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.042e-20■■■■■ 46.8
PRPF4O43172 DZIP1-205ENST00000466027 1580 ntTSL 221.7■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 46.7
PRPF4O43172 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 46.7
PRPF4O43172 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 46.7
PRPF4O43172 RHPN2-204ENST00000588388 2378 ntTSL 213.29□□□□□ -0.288e-9■■■■■ 46.3
PRPF4O43172 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.858e-9■■■■■ 46.3
PRPF4O43172 KAT2A-204ENST00000588759 404 ntTSL 59.57□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 46
PRPF4O43172 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.238e-47■■■■■ 45.9
PRPF4O43172 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.284e-14■■■■■ 45.2
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